181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3012 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 163 aa  330  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  98.16 
 
 		 163 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  79.14 
 
 		 160 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  73.57 
 
 		 154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 237 aa  189  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 174 aa  186  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  57.42 
 
 		 169 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  55.97 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  62.88 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  60.58 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 226 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  59.09 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 169 aa  153  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  59.69 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  63.11 
 
 		 187 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  63.48 
 
 		 191 aa  150  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  63.48 
 
 		 191 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 179 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  49.61 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 146 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 172 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  35.29 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.68 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 160 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  42.97 
 
 		 183 aa  89  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 170 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  27.72 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  26.43 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  26.92 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  32.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  32.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  32.65 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>