More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2501 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  61.06 
 
 
928 aa  1001    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  100 
 
 
942 aa  1818    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  56.63 
 
 
932 aa  886    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  54.96 
 
 
928 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.17 
 
 
1156 aa  165  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.37 
 
 
1480 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  31.12 
 
 
1499 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.57 
 
 
2911 aa  147  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.71 
 
 
3954 aa  146  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 
4334 aa  145  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  29.3 
 
 
4798 aa  142  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.42 
 
 
855 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 
946 aa  139  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.95 
 
 
1079 aa  133  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  32.12 
 
 
1400 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  38.49 
 
 
518 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  33.08 
 
 
2954 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29.93 
 
 
860 aa  130  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.51 
 
 
3598 aa  128  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  38.6 
 
 
2667 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.05 
 
 
1421 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.09 
 
 
3026 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  31.2 
 
 
1306 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.92 
 
 
2689 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  38.49 
 
 
1534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  27.55 
 
 
4723 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.6 
 
 
2678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  33.25 
 
 
833 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 
1855 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.79 
 
 
3427 aa  118  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.44 
 
 
2107 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.78 
 
 
1279 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.4 
 
 
795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 
387 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  35.42 
 
 
820 aa  115  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  34.78 
 
 
595 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.12 
 
 
1532 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  28.76 
 
 
2133 aa  114  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.74 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  30.33 
 
 
4800 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  28.6 
 
 
1582 aa  111  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.59 
 
 
2775 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 
1884 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.83 
 
 
1363 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.63 
 
 
3619 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
2105 aa  107  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.5 
 
 
1180 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  29.92 
 
 
824 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  29.18 
 
 
767 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.43 
 
 
3608 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.9 
 
 
4687 aa  105  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  33.33 
 
 
959 aa  104  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  37.32 
 
 
491 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  30.15 
 
 
998 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  36.11 
 
 
867 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.68 
 
 
387 aa  102  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.03 
 
 
980 aa  102  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  29.85 
 
 
965 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  49.64 
 
 
709 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  29 
 
 
1168 aa  101  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  37.31 
 
 
329 aa  101  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  37.31 
 
 
329 aa  101  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 
1895 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.05 
 
 
1795 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  31.35 
 
 
2836 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  27.24 
 
 
1217 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.64 
 
 
1287 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.64 
 
 
421 aa  98.6  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.15 
 
 
3209 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  39.55 
 
 
2329 aa  97.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  35.47 
 
 
534 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.18 
 
 
589 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  50.74 
 
 
3619 aa  97.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  35.06 
 
 
999 aa  96.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  49.22 
 
 
950 aa  96.3  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  29.96 
 
 
1286 aa  95.5  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.65 
 
 
1544 aa  95.1  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.55 
 
 
1236 aa  95.1  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  32.34 
 
 
2097 aa  94.7  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.67 
 
 
2245 aa  94.7  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  34.32 
 
 
396 aa  93.6  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  49.59 
 
 
813 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  30.43 
 
 
856 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.92 
 
 
1145 aa  92.8  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 
526 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.22 
 
 
1164 aa  92  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  33.89 
 
 
1055 aa  91.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  54.95 
 
 
2885 aa  92  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  30.31 
 
 
5769 aa  91.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1796  hemolysin-type calcium-binding region  32.04 
 
 
537 aa  91.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47796  hitchhiker  0.00183267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0833  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 
571 aa  91.3  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.04 
 
 
613 aa  90.9  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.79 
 
 
2467 aa  90.5  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.7 
 
 
1415 aa  90.5  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.48 
 
 
1424 aa  89.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  62.2 
 
 
589 aa  89.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  44.52 
 
 
424 aa  89  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.12 
 
 
588 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.55 
 
 
1963 aa  89  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  33.83 
 
 
682 aa  88.6  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0651981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>