More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4480 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  95.05 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  75.57 
 
 		 223 aa  350  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  65.37 
 
 		 223 aa  285  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  62.62 
 
 		 231 aa  271  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  61.86 
 
 		 231 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  59.82 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  62.56 
 
 		 236 aa  269  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  58.53 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  61.29 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  56.81 
 
 		 228 aa  254  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  56.16 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  57.53 
 
 		 225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  57.99 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  56.68 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  57.6 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  53.88 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  57.97 
 
 		 240 aa  244  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  57.53 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  56.25 
 
 		 223 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  57.41 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  59.42 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  59.42 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  47.35 
 
 		 281 aa  231  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  49.33 
 
 		 232 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  53.7 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  53.7 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  53.7 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  48 
 
 		 231 aa  208  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  47.09 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  46.88 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  49.28 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  43.69 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  46.61 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  46.15 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  44.49 
 
 		 389 aa  196  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  46.95 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  46.4 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  47.42 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  45.7 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  45.75 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  43.11 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  44.34 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  44.34 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  44.89 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  45.45 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  43.44 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  39.91 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  37.84 
 
 		 240 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  37.91 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  30.97 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.59 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  33.5 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  28.88 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.88 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.88 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.88 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.88 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.45 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.45 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  30.63 
 
 		 246 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 193 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.31 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  28.88 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  36.27 
 
 		 243 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 		 245 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 190 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 188 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 191 aa  88.2  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.66 
 
 		 248 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  29.74 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  28.44 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  26.79 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  29.31 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  29.12 
 
 		 180 aa  85.5  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  33.72 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.04 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  34 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  31.92 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  34.27 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  26.42 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>