More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6386 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 510 aa  1054    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 477 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  55.74 
 
 		 477 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 224 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 244 aa  94  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 228 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 225 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 213 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 222 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 236 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 225 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 203 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 258 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 258 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 202 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 207 aa  54.7  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 213 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 201 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 214 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 212 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 228 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 212 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 246 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 226 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 209 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 232 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 216 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  27.54 
 
 		 197 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 194 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 216 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 206 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 222 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 203 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 210 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 193 aa  50.4  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 235 aa  50.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 211 aa  50.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 193 aa  50.4  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 234 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 239 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 235 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 209 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5469  putative transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 241 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200431 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 215 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  49.3  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 213 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  23.96 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 189 aa  49.3  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 177 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 272 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 229 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 204 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 245 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 332 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 219 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 228 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  38.46 
 
 		 220 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 207 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 225 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 275 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>