More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0379 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 403 aa  832    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  71.67 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  72.24 
 
 		 392 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.87 
 
 		 345 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.46 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.84 
 
 		 344 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.15 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.15 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.24 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.15 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.04 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.99 
 
 		 350 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.99 
 
 		 350 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  52.03 
 
 		 447 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  52.03 
 
 		 429 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  32.03 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.24 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  36.08 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.53 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  38.33 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  35.6 
 
 		 345 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  38.18 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  29.27 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  45.75 
 
 		 380 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.5 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  41.52 
 
 		 201 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1967  OmpA/MotB domain-containing protein  44.38 
 
 		 213 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.7 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  38.62 
 
 		 201 aa  127  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.03 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.92 
 
 		 209 aa  126  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  32.17 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  43.29 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  42.48 
 
 		 201 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0596  OmpA/MotB  42.42 
 
 		 218 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0593413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 201 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  44.97 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  39.74 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0594  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 232 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0595  OmpA/MotB  35.94 
 
 		 194 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  28.19 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  27.21 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  41.83 
 
 		 201 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  40.83 
 
 		 201 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  35.93 
 
 		 368 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  40.12 
 
 		 201 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  46.26 
 
 		 478 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  31.42 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  33.19 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.03 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.03 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.44 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 		 200 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  26.91 
 
 		 466 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  31.95 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.91 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  43.71 
 
 		 375 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  29.3 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 		 202 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 319 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 202 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  40.65 
 
 		 201 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 		 372 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.77 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.21 
 
 		 240 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  48.74 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 185 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  31.88 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  29.89 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  29.89 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  48.74 
 
 		 466 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  40 
 
 		 204 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  30.06 
 
 		 319 aa  106  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  48.31 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 210 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  40.61 
 
 		 212 aa  106  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.54 
 
 		 319 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  37.71 
 
 		 204 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  30.77 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  46.85 
 
 		 327 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  36.08 
 
 		 205 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  49.15 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.75 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  32.41 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  32.93 
 
 		 328 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  38.85 
 
 		 348 aa  99.8  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.65 
 
 		 218 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>