More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2607 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 832 aa  1686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  55 
 
 		 833 aa  890    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  48.86 
 
 		 849 aa  752    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  47.85 
 
 		 811 aa  690    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  40.56 
 
 		 821 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  40.07 
 
 		 815 aa  529  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  40.79 
 
 		 842 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 835 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 843 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  35.22 
 
 		 840 aa  432  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.73 
 
 		 800 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  37.22 
 
 		 784 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  35.4 
 
 		 811 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 853 aa  418  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 800 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 804 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  35.94 
 
 		 795 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 793 aa  405  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.42 
 
 		 811 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  35.59 
 
 		 793 aa  402  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 795 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.48 
 
 		 883 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 817 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  34.14 
 
 		 797 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  33.78 
 
 		 797 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 795 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  33.45 
 
 		 961 aa  392  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 803 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 812 aa  389  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 812 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  34.55 
 
 		 884 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 815 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 		 847 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 818 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 871 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  32.57 
 
 		 788 aa  361  3e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 788 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.67 
 
 		 799 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 842 aa  352  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  31.18 
 
 		 797 aa  350  9e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 816 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 933 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 		 885 aa  328  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 868 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 803 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  32.15 
 
 		 823 aa  323  7e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 847 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 853 aa  322  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.09 
 
 		 856 aa  321  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 918 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 858 aa  319  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 813 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 948 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.98 
 
 		 867 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 924 aa  312  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.44 
 
 		 864 aa  310  6.999999999999999e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 987 aa  310  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 851 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 861 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 858 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 817 aa  304  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  30.23 
 
 		 1015 aa  303  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.48 
 
 		 870 aa  303  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 869 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 857 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 850 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  31.29 
 
 		 848 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 947 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 870 aa  290  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 800 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 924 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 874 aa  285  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 872 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 887 aa  270  5.9999999999999995e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 873 aa  260  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 852 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 879 aa  237  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  29.64 
 
 		 948 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  37.83 
 
 		 867 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 867 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  38.04 
 
 		 877 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 869 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 873 aa  129  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 867 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2049  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 867 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115789  normal  0.0404089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1986  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 867 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.430479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 866 aa  126  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2338  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 867 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.094918  normal  0.111511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 869 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 817 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1939  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 854 aa  107  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.246541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 954 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1754  putative outer membrane cobalamin receptor protein  35.55 
 
 		 834 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.902091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 871 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  37.63 
 
 		 855 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1120  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 942 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 897 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>