More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3557 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.5 
 
 		 688 aa  793    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  59.94 
 
 		 688 aa  790    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1940  methyl-accepting chemotaxis transducer  63.6 
 
 		 716 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000108039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  100 
 
 		 714 aa  1440    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.36 
 
 		 688 aa  794    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.58 
 
 		 714 aa  1432    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.64 
 
 		 714 aa  1336    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  58.26 
 
 		 712 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  80.84 
 
 		 715 aa  1141    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.14 
 
 		 714 aa  1291    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  51.34 
 
 		 738 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  67.32 
 
 		 714 aa  940    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.08 
 
 		 688 aa  788    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.65 
 
 		 714 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  67.04 
 
 		 714 aa  934    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 		 713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.46 
 
 		 712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.35 
 
 		 712 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.99 
 
 		 716 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  36.89 
 
 		 706 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  34.79 
 
 		 701 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  36.73 
 
 		 697 aa  330  8e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.89 
 
 		 695 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  34.31 
 
 		 698 aa  317  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003063  methyl-accepting chemotaxis protein  35.2 
 
 		 682 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2635  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 706 aa  298  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.993869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 705 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.568622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 		 713 aa  293  8e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.59 
 
 		 706 aa  292  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.59 
 
 		 705 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 707 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0911  chemotaxis sensory transducer  31.87 
 
 		 705 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000403524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 		 706 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 		 706 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.14 
 
 		 705 aa  287  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.58 
 
 		 706 aa  287  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  35.95 
 
 		 623 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.85 
 
 		 634 aa  286  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 		 626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.18 
 
 		 706 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.307732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.38 
 
 		 730 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2991  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.36 
 
 		 706 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 627 aa  280  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.75 
 
 		 741 aa  280  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 		 699 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  37.04 
 
 		 623 aa  278  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  46.7 
 
 		 634 aa  276  7e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1278  methyl-accepting chemotaxis protein  30.68 
 
 		 706 aa  276  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 		 638 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1103  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.46 
 
 		 706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.540965  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 		 640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.55 
 
 		 730 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.57 
 
 		 622 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 		 634 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  48.1 
 
 		 559 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.5 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.83 
 
 		 637 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.7 
 
 		 636 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.35 
 
 		 638 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 		 639 aa  265  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.6 
 
 		 627 aa  262  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.99 
 
 		 622 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 		 541 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 633 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 633 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.28 
 
 		 633 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 		 640 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.32 
 
 		 638 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2050  methyl-accepting chemotaxis protein  29.11 
 
 		 704 aa  260  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.459277  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 		 636 aa  260  7e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  46.02 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 628 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  28.82 
 
 		 740 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.08 
 
 		 628 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  34.26 
 
 		 643 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 		 638 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 		 540 aa  258  4e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  44.51 
 
 		 633 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 		 674 aa  258  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 		 637 aa  257  7e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.38 
 
 		 619 aa  256  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  32.35 
 
 		 626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.81 
 
 		 622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 		 773 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.8 
 
 		 564 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.8 
 
 		 638 aa  253  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.46 
 
 		 626 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 		 560 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  34.23 
 
 		 652 aa  252  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.13 
 
 		 731 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 		 568 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 		 560 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.52 
 
 		 549 aa  250  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  48.05 
 
 		 561 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  35.3 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.36 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  46.18 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.45 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  48.17 
 
 		 561 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>