271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2225 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  100 
 
 		 298 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  44.96 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  45.17 
 
 		 306 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  41.03 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  44.69 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  39.79 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  40.95 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  37.71 
 
 		 316 aa  202  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  39.29 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  37.5 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  39.36 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  40.91 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  37.63 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 427 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  36.52 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  37 
 
 		 324 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  40.77 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  41.28 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  35.92 
 
 		 322 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  41.79 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  43.73 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  38.87 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  43.63 
 
 		 329 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  43.63 
 
 		 329 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  38.19 
 
 		 329 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  34.16 
 
 		 424 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  37.15 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  36.26 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  38.69 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  36.27 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  36.82 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  39.61 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  37.63 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  33.56 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  36.58 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  36.58 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  33.92 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  36.58 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  32.86 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  35.11 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  37.92 
 
 		 393 aa  147  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  34.15 
 
 		 443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.75 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  32.27 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.88 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  34.88 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.88 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.88 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.88 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.88 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  33.58 
 
 		 436 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  36.1 
 
 		 411 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  39.39 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  33.33 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  34.66 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  32.06 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  33.48 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  33.48 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  33.46 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  31.32 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  32.24 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  30.8 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  31.2 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  32.42 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  30.77 
 
 		 368 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4026  ribonuclease BN  29.29 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.194003 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1406  ribonuclease BN  25 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.573356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  28.35 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  26.86 
 
 		 276 aa  90.1  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3407  ribonuclease BN  23.31 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.57313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2696  ribonuclease BN  23.31 
 
 		 322 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  34.72 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3965  ribonuclease BN  25.7 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1131  tRNA-processing RNAse BN  28.79 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  28.28 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  26.62 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1250  tRNA-processing RNAse BN  26.4 
 
 		 444 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1575  ribonuclease BN  27.73 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1559  putative ribonuclease BN transmembrane protein  28.24 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1377  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763301  normal  0.704772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0974  ribonuclease BN, putative  26.1 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4092  ribonuclease BN  26.97 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1456  putative ribonuclease BN  26.1 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1434  ribonuclease BN  26.1 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  39.08 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0942  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1862  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4601  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1685  tRNA-processing ribonuclease BN  25.08 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1475  ribonuclease BN  25.08 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  28.08 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1707  tRNA-processing ribonuclease BN  25.08 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  38.64 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4618  ribonuclease BN  26.13 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.331921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  26.89 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4238  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.89383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>