More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0765 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  44.02 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  42.77 
 
 
201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 
201 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
201 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  42.7 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  45.66 
 
 
207 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
221 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
200 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
201 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 
221 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
208 aa  121  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
201 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  36.02 
 
 
193 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
204 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
204 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
204 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0193  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
202 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 
192 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  38.3 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
188 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
190 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
189 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
210 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0355  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
192 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0481105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
195 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
179 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2715  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
189 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
190 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
196 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
195 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2890  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 
202 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
192 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
202 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 
179 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1371  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 
189 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
228 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
202 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
191 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 
187 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  40.83 
 
 
192 aa  103  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
197 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5255  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
196 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1385  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 
178 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5634  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
196 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5344  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
196 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772275  normal  0.605205 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  34.15 
 
 
199 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
187 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
186 aa  101  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
210 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
210 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1449  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
203 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126985  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
206 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 
234 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2930  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0127  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 
191 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00410003  normal  0.28897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3995  regulatory protein, TetR  35.56 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
200 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  33.16 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
176 aa  95.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
188 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 
188 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0446716 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
211 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3097  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.127725  normal 
 
 
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NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.137134 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
188 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0135  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 
181 aa  92  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
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