More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0293 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  100 
 
 		 514 aa  1033    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4095  RND family efflux transporter MFP subunit  45.32 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4388  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.51 
 
 		 551 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.420196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  35.68 
 
 		 524 aa  219  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1583  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 564 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.936512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.69 
 
 		 553 aa  150  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  31.75 
 
 		 582 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0065  RND family efflux transporter MFP subunit  27.99 
 
 		 324 aa  120  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  29.78 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1241  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 417 aa  104  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.975545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1403  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.424837  normal  0.123182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  26.78 
 
 		 423 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  28.93 
 
 		 398 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1182  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.61 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.09 
 
 		 427 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  25.99 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  27.57 
 
 		 384 aa  97.8  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 410 aa  97.4  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.57 
 
 		 346 aa  97.4  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  24.13 
 
 		 424 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  27.15 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 580 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  29.23 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.33 
 
 		 400 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.73 
 
 		 362 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.76 
 
 		 512 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2383  RND family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 530 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182874  normal  0.0987183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  28.65 
 
 		 504 aa  90.9  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.97 
 
 		 385 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0994  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 583 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  28.96 
 
 		 546 aa  90.5  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  29.02 
 
 		 253 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5714  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.04 
 
 		 420 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 537 aa  88.2  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  27.99 
 
 		 629 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 509 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  24.66 
 
 		 388 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 478 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.85 
 
 		 486 aa  87  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 526 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1239  RND family efflux transporter MFP subunit  26.96 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.83 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.26 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  0.384279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 568 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1747  hypothetical protein  26.44 
 
 		 563 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.47098  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  25.56 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0182  RND family efflux transporter MFP subunit  26.38 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.833766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.53 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  26.9 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.49 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.24 
 
 		 538 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.95 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  24.46 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  23.65 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4090  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.22 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6756  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.03 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  27.14 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 473 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  27.22 
 
 		 357 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  27.83 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2552  secretion protein HlyD  26.13 
 
 		 410 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  27.14 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.14 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  29.12 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  27.14 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2505  RND family efflux transporter MFP subunit  26.39 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0949204  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  27.14 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  31.11 
 
 		 527 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  27.14 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  27.14 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  25.59 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.53 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  26.49 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  27.14 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1104  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 579 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0417227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  27.24 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  24.59 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  24.37 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  28.02 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>