More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0786 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 245 aa  311  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2899  GntR family transcriptional regulator  59.4 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527875  normal  0.0122308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3327  GntR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.545906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  50.21 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1334  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  42.08 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  37.04 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3277  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5216  transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2587  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0496  transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.50739  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4416  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3003  GntR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 216 aa  123  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.88449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 231 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1896  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.280079  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1712  transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 216 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5325  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 263 aa  88.6  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 226 aa  85.5  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 231 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  35.2 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3597  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0217  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3461  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0238  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0670401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1816  regulatory protein, GntR  31.05 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0697893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  32.64 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  36 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4198  GntR domain protein  33.83 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  43.68 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>