More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8309 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 318 aa  634    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5902  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 307 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  0.230241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  49.33 
 
 		 300 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.64 
 
 		 300 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2373  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 300 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0629728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5583  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542603  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 298 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5135  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5310  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2486  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5943  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.180862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3891  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314742  normal  0.132364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3004  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2594  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.437006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0713  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730012  normal  0.411699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3116  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1919  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.56 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0886  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0376917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0889  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 338 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0345  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0092  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0644  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0772357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2479  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1018  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.379655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2833  LysR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.823205  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 314 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 414 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3489  LysR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 330 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4979  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 318 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0548  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3807  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 408 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.62 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 481 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1029  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.850278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 298 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  27.67 
 
 		 294 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1678  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  30.15 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  23.31 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4205  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2069  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18458  hitchhiker  0.00114846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.03 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 426 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2769  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.8 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5236  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3409  LysR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000205674  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1368  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 397 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  30.58 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>