More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6504 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  72.69 
 
 		 503 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  72.75 
 
 		 508 aa  670    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  100 
 
 		 502 aa  986    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  73.73 
 
 		 501 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  72.69 
 
 		 503 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  92.48 
 
 		 504 aa  914    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  71.58 
 
 		 496 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  71.7 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  71.4 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  57.48 
 
 		 527 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  55.86 
 
 		 523 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  53.44 
 
 		 524 aa  475  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  54.1 
 
 		 537 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  53.43 
 
 		 529 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  52.41 
 
 		 528 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  52.82 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  52.42 
 
 		 520 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  54.27 
 
 		 525 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  53.74 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  50.29 
 
 		 528 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  50.97 
 
 		 526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  49.52 
 
 		 527 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  48.26 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  50.1 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  48.93 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  49.6 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  49.6 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  49.39 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  46.92 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  53.22 
 
 		 509 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.71 
 
 		 491 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  47.7 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  47.49 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.7 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.11 
 
 		 487 aa  349  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.24 
 
 		 483 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.04 
 
 		 483 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.64 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.64 
 
 		 493 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  43.35 
 
 		 493 aa  339  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  42.74 
 
 		 483 aa  336  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  45.73 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.73 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  48.47 
 
 		 524 aa  329  7e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  40.24 
 
 		 588 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.46 
 
 		 471 aa  329  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  39.59 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.19 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.08 
 
 		 522 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  44.37 
 
 		 511 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  39.59 
 
 		 524 aa  326  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.12 
 
 		 497 aa  325  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.63 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.15 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.72 
 
 		 528 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  44.02 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  44.23 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  45 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  38.96 
 
 		 496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  41.44 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  42.68 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  41.63 
 
 		 499 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  43.04 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  42.58 
 
 		 524 aa  316  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.96 
 
 		 501 aa  316  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  42.45 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.32 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  42.35 
 
 		 523 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.68 
 
 		 501 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.51 
 
 		 508 aa  312  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  40.31 
 
 		 500 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.64 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.95 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  43.8 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.09 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.87 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.26 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.92 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.22 
 
 		 475 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.96 
 
 		 513 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.08 
 
 		 518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  45.02 
 
 		 516 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.65 
 
 		 477 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  42.32 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  44.87 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.63 
 
 		 479 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  40.59 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  41.2 
 
 		 497 aa  299  9e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  46.44 
 
 		 473 aa  299  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  42.57 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  39 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.63 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  41.67 
 
 		 481 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  39.16 
 
 		 525 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  44.55 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 473 aa  296  9e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  38.05 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  40.36 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  39.45 
 
 		 497 aa  291  3e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.24 
 
 		 480 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>