126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0045 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  958    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  44.44 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  43.88 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  42.77 
 
 		 524 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  44.56 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  40.75 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  41.68 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  43.84 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  41.25 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  40.29 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  41.75 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  39.48 
 
 		 512 aa  383  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  39.79 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  39.63 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  40.85 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  40.49 
 
 		 549 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  38.86 
 
 		 519 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  38 
 
 		 1033 aa  341  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  37.57 
 
 		 538 aa  336  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  34.77 
 
 		 537 aa  329  6e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  35.27 
 
 		 539 aa  319  7.999999999999999e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  30.34 
 
 		 436 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  29.73 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  29.52 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  29.52 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.29 
 
 		 447 aa  153  8e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.5 
 
 		 465 aa  150  5e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  26.73 
 
 		 446 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.56 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 722 aa  136  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.45 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  26.56 
 
 		 452 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  25.28 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  24.15 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  22.56 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.63 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  22.86 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  26.01 
 
 		 424 aa  118  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  22.27 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  19.91 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  24.83 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  24.94 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.25 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  21.96 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  21.93 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.99 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.98 
 
 		 428 aa  97.1  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 		 532 aa  94.4  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  21.67 
 
 		 1293 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  22.37 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.87 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  21.87 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.82 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.11 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  23.04 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  21.91 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.83 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.83 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  20.67 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  27.39 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  20.32 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.99 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.68 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  24.62 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  20.86 
 
 		 509 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  27.61 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.88 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  19.48 
 
 		 453 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  30.34 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 347 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  22.63 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  23.29 
 
 		 989 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  27.43 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  20.09 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  22.11 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  23.5 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  40.85 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3523  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  51.22 
 
 		 550 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  26.16 
 
 		 394 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  50 
 
 		 938 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  47.73 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.78 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0081  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.78 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0086  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.78 
 
 		 549 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0288135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  18.56 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  20 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2406  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.3 
 
 		 648 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0287125  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0272  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000698819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3749  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.986729  normal  0.0743978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05750  putative oxidoreductase  45.65 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3931  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.85 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4121  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  48.78 
 
 		 549 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3639  putative oxidoreductase  45.65 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.71 
 
 		 557 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4453  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  48.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0273  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  48.78 
 
 		 549 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.134326  hitchhiker  0.000000385441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>