119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0005 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  36.53 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  27.03 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  29.84 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  39.39 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 247 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.67 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  32.89 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 179 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  41.51 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 204 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  42  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 226 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 213 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 215 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 210 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 198 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 204 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  35.71 
 
 		 215 aa  42  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 199 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 210 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  42  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 211 aa  42  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.29 
 
 		 217 aa  42  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.29 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>