More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0678 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
1073 aa  2199  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
1069 aa  274  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
4079 aa  187  1e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
927 aa  176  3e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.71 
 
 
1694 aa  165  4e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.88 
 
 
1067 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
1276 aa  139  3e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.38 
 
 
1979 aa  130  1e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
1049 aa  128  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.24 
 
 
1138 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 
562 aa  124  1e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
878 aa  117  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 
602 aa  116  2e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.29 
 
 
1676 aa  115  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
543 aa  114  8e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  18.76 
 
 
2059 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.26 
 
 
810 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.08 
 
 
988 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.1 
 
 
1056 aa  104  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.6 
 
 
436 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.67 
 
 
1022 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.5 
 
 
1056 aa  100  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  20.99 
 
 
1297 aa  98.6  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 
1013 aa  98.2  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.06 
 
 
1486 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 
750 aa  96.3  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 
1737 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.85 
 
 
1056 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  21.28 
 
 
643 aa  93.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.34 
 
 
2240 aa  92.8  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.62 
 
 
576 aa  92  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.69 
 
 
818 aa  91.3  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
955 aa  91.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  20 
 
 
565 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 
614 aa  90.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.65 
 
 
936 aa  89  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.51 
 
 
1421 aa  89  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 
366 aa  88.6  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 
689 aa  87.8  1e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
3172 aa  87.4  1e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.27 
 
 
764 aa  87.4  1e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 
784 aa  87  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 
955 aa  87  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 
564 aa  87  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.57 
 
 
887 aa  87  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  23.72 
 
 
795 aa  86.3  3e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.26 
 
 
397 aa  85.5  5e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 
356 aa  84.3  1e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.08 
 
 
573 aa  84.3  1e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
393 aa  84  1e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 
402 aa  83.6  2e-14  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
592 aa  83.2  2e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
589 aa  83.2  2e-14  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 
465 aa  82.4  4e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.3 
 
 
745 aa  80.9  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
804 aa  81.3  1e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
767 aa  80.9  1e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
409 aa  80.5  2e-13  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
747 aa  80.1  2e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 
591 aa  79.3  3e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.57665e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 
626 aa  79.3  3e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 
614 aa  79.3  4e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
614 aa  79.3  4e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 
614 aa  79.3  4e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
614 aa  78.6  5e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
615 aa  79  5e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  20.46 
 
 
594 aa  78.6  5e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 
632 aa  78.6  6e-13  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  25.31 
 
 
626 aa  78.6  6e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
3145 aa  78.6  7e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.26 
 
 
648 aa  78.2  8e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  25.62 
 
 
626 aa  78.2  8e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  19.44 
 
 
486 aa  77.8  1e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
1161 aa  77.8  1e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.36 
 
 
573 aa  77  2e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  19.7 
 
 
1213 aa  77  2e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 
1061 aa  77  2e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
681 aa  76.6  2e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.27 
 
 
620 aa  76.6  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 
740 aa  76.3  3e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
828 aa  76.3  3e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.52 
 
 
2401 aa  76.6  3e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 
614 aa  76.3  3e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
448 aa  75.9  4e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
450 aa  75.9  4e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
620 aa  75.9  4e-12  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 
597 aa  75.5  5e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.12 
 
 
267 aa  75.5  5e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
639 aa  75.5  5e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 
567 aa  75.5  5e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
955 aa  75.5  5e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 
395 aa  75.5  5e-12  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 
468 aa  75.1  6e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
467 aa  75.5  6e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.26 
 
 
725 aa  75.5  6e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 
505 aa  75.1  6e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.09 
 
 
837 aa  75.1  6e-12  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 
409 aa  75.1  7e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
617 aa  74.7  8e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
635 aa  74.3  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>