More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0560 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  60.44 
 
 		 274 aa  314  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  58.24 
 
 		 272 aa  305  7e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  56.2 
 
 		 277 aa  295  5e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  53.79 
 
 		 275 aa  278  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  52.55 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 280 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  38.65 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  39.36 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 		 282 aa  181  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  38.65 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 278 aa  178  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 279 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 278 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  36.7 
 
 		 407 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  38.35 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.92 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  36.68 
 
 		 288 aa  161  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  36.84 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 		 284 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  38.58 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.21 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.72 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 268 aa  155  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.88 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 281 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 277 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 261 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 368 aa  152  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 355 aa  151  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  37.18 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2006  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  35.76 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  34.71 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>