More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0671 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 309 aa  607  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  56.33 
 
 		 276 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  39.81 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  38.51 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 272 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 272 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  28.98 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  30.39 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.75 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  31.17 
 
 		 278 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  28.43 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  28.12 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  28.43 
 
 		 277 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  30.97 
 
 		 277 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  30.46 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  32.69 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  28.39 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  34.31 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  28.85 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  28.21 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.09 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  30.69 
 
 		 269 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  27.97 
 
 		 278 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 278 aa  116  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  31.48 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  27.8 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  30.62 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 260 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  28.48 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  27.48 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  29.45 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  29.32 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  30.13 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  33.12 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  31.7 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  32.89 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  28.89 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  30.79 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  34.31 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  30.62 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.52 
 
 		 268 aa  109  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  31.7 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.7 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  30.86 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  27.94 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  29.75 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  30.99 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0431  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  29.68 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  29.84 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  25.5 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>