More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4136 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5887  protease Do  71.77 
 
 		 504 aa  670    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  89.26 
 
 		 503 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  78.46 
 
 		 508 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  100 
 
 		 496 aa  963    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  98.19 
 
 		 496 aa  943    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  87.82 
 
 		 501 aa  788    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  91.73 
 
 		 496 aa  796    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  89.26 
 
 		 503 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  70.02 
 
 		 502 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  53.09 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  54.47 
 
 		 524 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  54.17 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  51.15 
 
 		 528 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  51.63 
 
 		 526 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  51.45 
 
 		 523 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  52.33 
 
 		 527 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  51.87 
 
 		 520 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  52.9 
 
 		 516 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  53.92 
 
 		 537 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  52.64 
 
 		 525 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  50.38 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  45.8 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  48.37 
 
 		 520 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  46.53 
 
 		 527 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  49.8 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  49.8 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  45.95 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  46.2 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  44.44 
 
 		 505 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  46.2 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  49.76 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  46.32 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  47.07 
 
 		 500 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.61 
 
 		 506 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  45.57 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.56 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.57 
 
 		 520 aa  343  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.57 
 
 		 511 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.49 
 
 		 524 aa  339  8e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.53 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  45.36 
 
 		 511 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.23 
 
 		 483 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.03 
 
 		 483 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.3 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  41.23 
 
 		 523 aa  333  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.73 
 
 		 506 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.73 
 
 		 493 aa  333  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  50.25 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  39.35 
 
 		 528 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  45.14 
 
 		 508 aa  330  4e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  41.52 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.08 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  42.05 
 
 		 508 aa  326  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  43.47 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.8 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.7 
 
 		 498 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  40.56 
 
 		 501 aa  322  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  43.2 
 
 		 501 aa  322  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.54 
 
 		 501 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  42.33 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  45.76 
 
 		 496 aa  316  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  42.92 
 
 		 535 aa  315  9e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.37 
 
 		 485 aa  315  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  39.76 
 
 		 522 aa  312  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.49 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44.78 
 
 		 498 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.37 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  42.52 
 
 		 501 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.45 
 
 		 524 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  41.51 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  44.39 
 
 		 497 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  43.12 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.44 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.6 
 
 		 588 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  46.3 
 
 		 578 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.01 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.76 
 
 		 477 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  43.95 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.52 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.81 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  44.2 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.95 
 
 		 458 aa  299  9e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  42.98 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  40.56 
 
 		 477 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.63 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  40.21 
 
 		 473 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.38 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.2 
 
 		 479 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.29 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  41.77 
 
 		 509 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  41.05 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  42.12 
 
 		 505 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  45.62 
 
 		 462 aa  292  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.65 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  39.57 
 
 		 510 aa  292  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  39.28 
 
 		 499 aa  292  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.51 
 
 		 481 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.18 
 
 		 478 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.78 
 
 		 485 aa  290  6e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.76 
 
 		 481 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>