More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0731 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  100 
 
 
558 aa  1154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  52.22 
 
 
549 aa  608  1e-172  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  48.9 
 
 
549 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  47.83 
 
 
628 aa  505  1e-142  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  46.64 
 
 
542 aa  493  1e-138  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  47.51 
 
 
556 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  44.3 
 
 
640 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  44.19 
 
 
797 aa  485  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  45.71 
 
 
551 aa  463  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  43.13 
 
 
654 aa  452  1e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  44.31 
 
 
591 aa  455  1e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  44.51 
 
 
682 aa  453  1e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  45.15 
 
 
609 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  43.53 
 
 
749 aa  442  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
791 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  41.6 
 
 
547 aa  431  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  45.61 
 
 
1255 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  38.36 
 
 
1319 aa  405  1e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  45.16 
 
 
847 aa  398  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
831 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  44.02 
 
 
1335 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  41.22 
 
 
770 aa  392  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
583 aa  389  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  40.5 
 
 
692 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  41.19 
 
 
545 aa  373  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  40.54 
 
 
991 aa  365  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.37 
 
 
722 aa  334  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.27 
 
 
519 aa  333  4e-90  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
510 aa  327  3e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.25 
 
 
671 aa  323  4e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  50.36 
 
 
612 aa  300  6e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  39.47 
 
 
618 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.98 
 
 
491 aa  278  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.05 
 
 
604 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  39.1 
 
 
617 aa  276  9e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  40 
 
 
512 aa  273  6e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
547 aa  270  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
513 aa  270  5e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
492 aa  268  2e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  36.64 
 
 
620 aa  267  5e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.84 
 
 
622 aa  266  6e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.19 
 
 
492 aa  264  3e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.18 
 
 
489 aa  257  5e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
549 aa  256  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.49 
 
 
546 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
546 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  37 
 
 
546 aa  250  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
577 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  34.27 
 
 
546 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  35.2 
 
 
610 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.89 
 
 
572 aa  246  1e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.2 
 
 
557 aa  245  1e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
557 aa  243  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  32.09 
 
 
557 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  31.49 
 
 
559 aa  236  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  31.17 
 
 
557 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
543 aa  230  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  35.59 
 
 
548 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
552 aa  224  4e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
553 aa  220  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
553 aa  220  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
553 aa  220  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
553 aa  220  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  34.76 
 
 
552 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
544 aa  213  9e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
473 aa  200  5e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  31.95 
 
 
311 aa  191  4e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  41.6 
 
 
440 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
476 aa  176  1e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  30.18 
 
 
515 aa  176  1e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  174  4e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  39.26 
 
 
440 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
454 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.7 
 
 
594 aa  168  3e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
438 aa  167  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.03 
 
 
447 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  38.41 
 
 
447 aa  166  1e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  2.24608e-07 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  37.85 
 
 
455 aa  166  1e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
450 aa  165  2e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
450 aa  165  2e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  38.66 
 
 
450 aa  165  2e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.1609e-06 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
451 aa  165  2e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
451 aa  165  2e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  37.15 
 
 
447 aa  164  5e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  37.15 
 
 
447 aa  164  5e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  37.15 
 
 
447 aa  164  5e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
449 aa  164  5e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.15 
 
 
450 aa  164  5e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  38.08 
 
 
446 aa  163  8e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  38.06 
 
 
469 aa  162  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  37.69 
 
 
469 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
463 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  31.69 
 
 
449 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.21 
 
 
444 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  27.92 
 
 
483 aa  157  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.37 
 
 
430 aa  157  5e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
472 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.94 
 
 
467 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  35.42 
 
 
634 aa  155  3e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.95 
 
 
412 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>