More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3458 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  56.65 
 
 		 606 aa  646    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 605 aa  1182    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  52.22 
 
 		 593 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  48.43 
 
 		 594 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  45.02 
 
 		 588 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  42.62 
 
 		 593 aa  463  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  45.24 
 
 		 632 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  42.24 
 
 		 620 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  40.03 
 
 		 590 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  42.26 
 
 		 641 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  39.87 
 
 		 590 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  42.67 
 
 		 591 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  44.5 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  42.19 
 
 		 593 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  42.55 
 
 		 593 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  41.5 
 
 		 586 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  39.64 
 
 		 591 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  42.64 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  36.5 
 
 		 590 aa  399  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  39.83 
 
 		 593 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  37.6 
 
 		 588 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  42.01 
 
 		 591 aa  389  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  37.64 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  42.11 
 
 		 592 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  39 
 
 		 590 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  39.54 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  39.33 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  36.77 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  36.77 
 
 		 619 aa  364  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  37.42 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  37.38 
 
 		 591 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  34.79 
 
 		 627 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  38.21 
 
 		 584 aa  292  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.1 
 
 		 602 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.39 
 
 		 596 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.76 
 
 		 612 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.75 
 
 		 597 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.95 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.85 
 
 		 623 aa  277  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.85 
 
 		 609 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.22 
 
 		 622 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.95 
 
 		 596 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.78 
 
 		 596 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.48 
 
 		 613 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.79 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  32.95 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  31.35 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.91 
 
 		 616 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  31.41 
 
 		 588 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.11 
 
 		 592 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  31.17 
 
 		 610 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  31.17 
 
 		 630 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.26 
 
 		 619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  31.01 
 
 		 610 aa  246  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.33 
 
 		 609 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.73 
 
 		 609 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  32.7 
 
 		 580 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.03 
 
 		 608 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28.96 
 
 		 621 aa  243  7.999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.76 
 
 		 592 aa  243  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  34.32 
 
 		 588 aa  243  7.999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.93 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  31.15 
 
 		 611 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.33 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.75 
 
 		 593 aa  241  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.76 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  32.62 
 
 		 618 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.87 
 
 		 613 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.84 
 
 		 609 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.84 
 
 		 609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  32.82 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.59 
 
 		 610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.4 
 
 		 589 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.06 
 
 		 599 aa  233  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 588 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  31.54 
 
 		 604 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.66 
 
 		 604 aa  232  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.03 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.57 
 
 		 591 aa  231  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.27 
 
 		 616 aa  231  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.92 
 
 		 609 aa  230  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.55 
 
 		 592 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  32.04 
 
 		 619 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  32.01 
 
 		 610 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  31.02 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.43 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.59 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.59 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.59 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.74 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.59 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.59 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.34 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.34 
 
 		 592 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  30.18 
 
 		 589 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  31.42 
 
 		 609 aa  223  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  31.53 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.43 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 608 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.36 
 
 		 588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>