More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1017 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 
391 aa  776  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  72.68 
 
 
388 aa  576  1e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  71.39 
 
 
388 aa  565  1e-160  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  71.13 
 
 
388 aa  563  1e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  70.88 
 
 
388 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  36.53 
 
 
558 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  34.18 
 
 
484 aa  183  4e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  36.04 
 
 
507 aa  182  9e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  34.91 
 
 
485 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  33.51 
 
 
486 aa  172  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 
566 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  31.99 
 
 
537 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  31.76 
 
 
546 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  43.72 
 
 
549 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  39.24 
 
 
529 aa  143  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  33.42 
 
 
497 aa  142  1e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  29.85 
 
 
403 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  2.90493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 
510 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  31.18 
 
 
415 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.18015e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1462  preprotein translocase subunit SecD  29.78 
 
 
411 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  5.72302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  28.11 
 
 
471 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 
564 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  27.27 
 
 
470 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  27.27 
 
 
470 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  28.07 
 
 
411 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  29.75 
 
 
410 aa  121  2e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  28.82 
 
 
735 aa  120  4e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  26.22 
 
 
461 aa  120  5e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  29.01 
 
 
403 aa  120  5e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.64404e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  26.4 
 
 
416 aa  119  1e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  3.01062e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  28.35 
 
 
445 aa  117  2e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.9832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  27.99 
 
 
406 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  27.21 
 
 
399 aa  114  2e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  25.52 
 
 
464 aa  113  7e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  26.93 
 
 
461 aa  112  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  26.82 
 
 
419 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  27.58 
 
 
413 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  2.93049e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  27.23 
 
 
441 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.45038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  25.92 
 
 
470 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  25.36 
 
 
472 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  27.12 
 
 
500 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  26.82 
 
 
419 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  28.71 
 
 
495 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  27.15 
 
 
503 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  26.56 
 
 
474 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  28.91 
 
 
843 aa  103  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.52 
 
 
849 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  24.78 
 
 
468 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.75 
 
 
785 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  24.43 
 
 
535 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.49 
 
 
785 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.57 
 
 
853 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.23 
 
 
759 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  26.38 
 
 
534 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  27.81 
 
 
656 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  26.19 
 
 
535 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.26 
 
 
846 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  25.68 
 
 
512 aa  97.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  23.66 
 
 
474 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.7 
 
 
848 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  25.99 
 
 
554 aa  96.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  25.24 
 
 
734 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  25.66 
 
 
534 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  27.46 
 
 
449 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  4.78055e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1501  protein-export membrane protein SecD  26.64 
 
 
793 aa  94.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.365573  normal  0.0601553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  24.94 
 
 
462 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  5.22922e-05  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  25.13 
 
 
554 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  25.5 
 
 
594 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  25.5 
 
 
594 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  26.84 
 
 
493 aa  94.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  27.57 
 
 
449 aa  94  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  23.71 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  25.91 
 
 
761 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  26.36 
 
 
531 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  27.23 
 
 
423 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  26.7 
 
 
449 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.19854e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  24.25 
 
 
531 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  25.32 
 
 
495 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  25.47 
 
 
533 aa  91.3  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  23.97 
 
 
856 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  24.57 
 
 
534 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  26.76 
 
 
839 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  25.71 
 
 
501 aa  89.7  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.14 
 
 
844 aa  89  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  26.14 
 
 
740 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.66 
 
 
834 aa  89.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  24.16 
 
 
556 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  25.41 
 
 
535 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1073  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.39 
 
 
753 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0361267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  25.26 
 
 
534 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  25.07 
 
 
532 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  25.47 
 
 
532 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  25.18 
 
 
464 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  25.07 
 
 
532 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.2 
 
 
844 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  25.14 
 
 
845 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  27.91 
 
 
638 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  28.46 
 
 
613 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  23.63 
 
 
554 aa  87.4  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  28.46 
 
 
613 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>