More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00294 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  100 
 
 		 676 aa  1396    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  41.38 
 
 		 680 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  41.12 
 
 		 668 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  41.09 
 
 		 680 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  41.49 
 
 		 677 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  35.14 
 
 		 686 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.23 
 
 		 698 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  32.67 
 
 		 672 aa  250  7e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  29.71 
 
 		 773 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  29.54 
 
 		 773 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  28.89 
 
 		 771 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  28.64 
 
 		 771 aa  228  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  29.05 
 
 		 766 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 		 775 aa  216  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  30.64 
 
 		 795 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  30.69 
 
 		 655 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  29.74 
 
 		 789 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  30.33 
 
 		 772 aa  200  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  31.72 
 
 		 711 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  29.03 
 
 		 789 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.52 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  29.64 
 
 		 573 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  28.17 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  27.44 
 
 		 753 aa  144  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  24.94 
 
 		 699 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.6 
 
 		 578 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.68 
 
 		 804 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  25.06 
 
 		 703 aa  97.4  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  40.94 
 
 		 577 aa  97.1  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  25.3 
 
 		 739 aa  97.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  39.86 
 
 		 570 aa  97.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  39.71 
 
 		 570 aa  95.5  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  39.71 
 
 		 570 aa  95.5  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  41.61 
 
 		 580 aa  95.1  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.57 
 
 		 805 aa  95.1  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.43 
 
 		 742 aa  94  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.3 
 
 		 704 aa  94  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.35 
 
 		 721 aa  94  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  26.68 
 
 		 746 aa  93.2  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.89 
 
 		 727 aa  92.8  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  36.02 
 
 		 569 aa  92.8  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  36.42 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  26.91 
 
 		 466 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.24 
 
 		 806 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  22.95 
 
 		 740 aa  91.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.7 
 
 		 757 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  25.18 
 
 		 713 aa  91.3  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.19 
 
 		 743 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  38.76 
 
 		 688 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.64 
 
 		 738 aa  90.1  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  22.17 
 
 		 703 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  35.03 
 
 		 617 aa  90.5  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.34 
 
 		 810 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  33.83 
 
 		 721 aa  89.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.88 
 
 		 737 aa  89  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.16 
 
 		 715 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  26.79 
 
 		 764 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  43.18 
 
 		 317 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  35.46 
 
 		 450 aa  89  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  34.46 
 
 		 1193 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.23 
 
 		 757 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  22.71 
 
 		 866 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.6 
 
 		 805 aa  88.2  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.88 
 
 		 760 aa  88.2  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.16 
 
 		 763 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.42 
 
 		 768 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  25.13 
 
 		 776 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  24.09 
 
 		 810 aa  86.3  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  31.85 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23 
 
 		 738 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  38.33 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.06 
 
 		 756 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.52 
 
 		 718 aa  85.9  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.9 
 
 		 723 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  35.25 
 
 		 749 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  27.86 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 826 aa  85.5  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23826  predicted protein  24.52 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  22.46 
 
 		 740 aa  85.5  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.83 
 
 		 736 aa  84.3  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.18 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30 
 
 		 739 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  32.16 
 
 		 1085 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  34.07 
 
 		 763 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.69 
 
 		 781 aa  84  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  21.88 
 
 		 742 aa  84  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.18 
 
 		 781 aa  84  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0668  AAA ATPase  30.23 
 
 		 480 aa  84  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.47 
 
 		 730 aa  84  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.84 
 
 		 759 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  25 
 
 		 601 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  29.95 
 
 		 439 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  22.86 
 
 		 753 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  23.91 
 
 		 754 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.9 
 
 		 757 aa  84  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  25 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.15 
 
 		 735 aa  83.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.97 
 
 		 808 aa  83.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.32 
 
 		 738 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>