More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0165 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  54.27 
 
 		 773 aa  802    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  54.27 
 
 		 771 aa  792    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  73.46 
 
 		 795 aa  1127    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  53.23 
 
 		 766 aa  799    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  54.4 
 
 		 773 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  69.08 
 
 		 789 aa  1083    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  70.66 
 
 		 775 aa  1073    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  100 
 
 		 772 aa  1549    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  52.5 
 
 		 771 aa  774    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  69.45 
 
 		 789 aa  1071    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  37.52 
 
 		 711 aa  366  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  34.54 
 
 		 655 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.72 
 
 		 698 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  33.22 
 
 		 672 aa  311  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  32.92 
 
 		 668 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  30.44 
 
 		 686 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  31.71 
 
 		 677 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.54 
 
 		 680 aa  207  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  30.33 
 
 		 676 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  30.8 
 
 		 680 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  31.35 
 
 		 731 aa  195  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  27.75 
 
 		 753 aa  190  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  30.92 
 
 		 573 aa  190  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  26.48 
 
 		 640 aa  180  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.38 
 
 		 754 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.02 
 
 		 754 aa  123  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.05 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.19 
 
 		 754 aa  114  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.75 
 
 		 738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28.51 
 
 		 550 aa  112  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  38.61 
 
 		 639 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.34 
 
 		 754 aa  108  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.82 
 
 		 740 aa  106  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.51 
 
 		 719 aa  106  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.11 
 
 		 739 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.49 
 
 		 756 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.22 
 
 		 718 aa  105  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.58 
 
 		 570 aa  104  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.08 
 
 		 806 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  43.36 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  43.36 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.1 
 
 		 727 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  46.38 
 
 		 749 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.49 
 
 		 801 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  41.38 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  43.54 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.58 
 
 		 754 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.03 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  42.06 
 
 		 432 aa  101  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.38 
 
 		 763 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.75 
 
 		 742 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  33.97 
 
 		 743 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.75 
 
 		 740 aa  99.8  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.74 
 
 		 755 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.78 
 
 		 723 aa  100  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.56 
 
 		 743 aa  100  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  41.26 
 
 		 656 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  27.91 
 
 		 787 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.25 
 
 		 704 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  26.9 
 
 		 713 aa  98.6  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.62 
 
 		 773 aa  98.6  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 744 aa  98.2  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  40.43 
 
 		 448 aa  97.8  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  41.04 
 
 		 580 aa  98.2  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.5 
 
 		 810 aa  97.8  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 		 662 aa  97.4  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.06 
 
 		 757 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.2 
 
 		 759 aa  97.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 826 aa  97.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  27.87 
 
 		 703 aa  97.1  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  29.75 
 
 		 764 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  42.36 
 
 		 634 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  30.88 
 
 		 725 aa  96.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  28.84 
 
 		 646 aa  96.3  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.44 
 
 		 757 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  43.7 
 
 		 665 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  38.64 
 
 		 442 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  26.7 
 
 		 810 aa  95.9  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.38 
 
 		 808 aa  95.5  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.05 
 
 		 738 aa  95.5  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  42.22 
 
 		 448 aa  95.5  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  39.01 
 
 		 1085 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 		 577 aa  95.1  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  28.83 
 
 		 570 aa  95.1  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  35.85 
 
 		 578 aa  94.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  38.81 
 
 		 569 aa  94.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  36.03 
 
 		 570 aa  94.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  28.38 
 
 		 570 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  43.09 
 
 		 441 aa  94  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  29.23 
 
 		 763 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.95 
 
 		 772 aa  93.2  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.75 
 
 		 805 aa  92.8  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  43.55 
 
 		 305 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  34.68 
 
 		 652 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  28.57 
 
 		 699 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  30.07 
 
 		 803 aa  92.4  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  38.73 
 
 		 466 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  27.31 
 
 		 691 aa  92.4  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.66 
 
 		 732 aa  92  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  39.57 
 
 		 697 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>