More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1305 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 731 aa  1504    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  64.81 
 
 		 573 aa  769    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  32.41 
 
 		 753 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.62 
 
 		 698 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  31.09 
 
 		 789 aa  212  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  31.29 
 
 		 711 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  30.82 
 
 		 672 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  30.91 
 
 		 775 aa  200  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 		 773 aa  200  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  33.2 
 
 		 766 aa  200  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 		 773 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  29.76 
 
 		 789 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  33.89 
 
 		 771 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  32.62 
 
 		 771 aa  196  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31.73 
 
 		 795 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  31.55 
 
 		 655 aa  194  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  31.35 
 
 		 772 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  30.59 
 
 		 686 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  23.63 
 
 		 640 aa  157  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  28.67 
 
 		 668 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  28.17 
 
 		 676 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  29.8 
 
 		 677 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  29.18 
 
 		 680 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  29.52 
 
 		 578 aa  99  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.94 
 
 		 744 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  32.5 
 
 		 478 aa  92.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  28.72 
 
 		 617 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 		 450 aa  92  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  32.83 
 
 		 743 aa  91.3  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  36.84 
 
 		 450 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  34.55 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  28.72 
 
 		 1085 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.83 
 
 		 805 aa  88.2  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  34.95 
 
 		 444 aa  86.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  36.62 
 
 		 305 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  33.9 
 
 		 1193 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 		 448 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  29.79 
 
 		 787 aa  85.9  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  35 
 
 		 652 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  36.2 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  35.82 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  31.99 
 
 		 699 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  32.76 
 
 		 697 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.46 
 
 		 577 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5232  AAA ATPase, central region  24.94 
 
 		 688 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000286955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  35.04 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  36.43 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  35.48 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  26.4 
 
 		 703 aa  81.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1548  AAA ATPase, central region  24.32 
 
 		 688 aa  81.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000910509  normal  0.627937 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.61 
 
 		 768 aa  81.3  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  34.29 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.14 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  35.29 
 
 		 441 aa  80.1  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.62 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.16 
 
 		 804 aa  79  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  28.88 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.83 
 
 		 731 aa  78.6  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  36.18 
 
 		 687 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  29.53 
 
 		 639 aa  78.2  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.2 
 
 		 760 aa  78.2  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.09 
 
 		 738 aa  78.2  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.23 
 
 		 740 aa  78.2  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.32 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.03 
 
 		 743 aa  77.4  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  35.25 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  26.85 
 
 		 781 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.98 
 
 		 756 aa  77  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0668  AAA ATPase  30.7 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  35.2 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.52 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.23 
 
 		 740 aa  75.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  25.33 
 
 		 639 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.95 
 
 		 742 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.17 
 
 		 759 aa  75.5  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.33 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.29 
 
 		 731 aa  75.9  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.86 
 
 		 731 aa  75.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  32.87 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  31.76 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  24.85 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  30.99 
 
 		 665 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.74 
 
 		 718 aa  75.1  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.36 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  30.99 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  27.7 
 
 		 656 aa  74.3  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  26.24 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  28.14 
 
 		 657 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  33.13 
 
 		 459 aa  73.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86905  cytoplasmic protein involved in protein transport between ER and Golgi ATPase  34.01 
 
 		 794 aa  73.6  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  27.75 
 
 		 647 aa  73.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  21.66 
 
 		 738 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.91 
 
 		 704 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.86 
 
 		 754 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.52 
 
 		 735 aa  73.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.75 
 
 		 806 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>