More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1579 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  98.6 
 
 
570 aa  1124    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  100 
 
 
570 aa  1137    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  63.7 
 
 
570 aa  704    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  98.42 
 
 
570 aa  1122    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  54.92 
 
 
580 aa  586  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  53.99 
 
 
569 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  47.68 
 
 
578 aa  520  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  49.74 
 
 
577 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  29.45 
 
 
617 aa  194  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 
725 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  30.38 
 
 
434 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  34 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  31.47 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  31.25 
 
 
478 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  29.69 
 
 
448 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  26.46 
 
 
442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  30.04 
 
 
441 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  28.47 
 
 
656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  31.54 
 
 
450 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  32.55 
 
 
697 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  31.3 
 
 
656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  33.64 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 
662 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  28.52 
 
 
657 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  27.97 
 
 
653 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  32.58 
 
 
450 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  29.2 
 
 
652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  29.43 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  29.8 
 
 
450 aa  128  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  30.68 
 
 
1085 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  26.19 
 
 
639 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  29.23 
 
 
619 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  29.73 
 
 
749 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  34.95 
 
 
466 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  28.52 
 
 
689 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  30.88 
 
 
665 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  29.17 
 
 
743 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  31.22 
 
 
450 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  31.73 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  28.79 
 
 
787 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  28.17 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  34.3 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  30.97 
 
 
1193 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  31.75 
 
 
352 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  28.38 
 
 
697 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  32.18 
 
 
459 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  28.98 
 
 
698 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  27.86 
 
 
788 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  31.15 
 
 
387 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.03 
 
 
391 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  26.79 
 
 
680 aa  107  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  29.33 
 
 
671 aa  107  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  27.75 
 
 
744 aa  107  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  26.54 
 
 
646 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 
678 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  34.73 
 
 
443 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  26.96 
 
 
687 aa  99.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  30.43 
 
 
682 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  32.28 
 
 
622 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  28.02 
 
 
299 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 
711 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  36.03 
 
 
772 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  39.71 
 
 
676 aa  95.5  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  26.91 
 
 
369 aa  95.1  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36.05 
 
 
795 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  37.25 
 
 
789 aa  94.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  36.46 
 
 
713 aa  94  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  30.73 
 
 
326 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.52 
 
 
732 aa  94  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  30.36 
 
 
775 aa  93.6  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  32.1 
 
 
415 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  32.99 
 
 
422 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  33.49 
 
 
393 aa  92  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  31.76 
 
 
725 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  35.95 
 
 
789 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  28.12 
 
 
308 aa  91.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  31.4 
 
 
410 aa  91.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  30.09 
 
 
404 aa  90.9  5e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  29.82 
 
 
814 aa  90.9  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  32.62 
 
 
640 aa  90.5  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  38.52 
 
 
655 aa  90.5  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  29.03 
 
 
389 aa  90.5  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  27.83 
 
 
450 aa  90.1  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.74 
 
 
756 aa  90.1  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 
428 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.28 
 
 
738 aa  89.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.02 
 
 
709 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  30.92 
 
 
367 aa  89.4  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  28.57 
 
 
371 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  30.86 
 
 
930 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  30.29 
 
 
387 aa  88.6  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  27.96 
 
 
239 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  32.34 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  31.28 
 
 
390 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  26.21 
 
 
336 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  29.29 
 
 
387 aa  87.8  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  27.59 
 
 
804 aa  87.8  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  27.96 
 
 
370 aa  87.4  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  28.74 
 
 
425 aa  87.4  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  27.83 
 
 
369 aa  87.4  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>