More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2115 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  99.48 
 
 		 773 aa  1576    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  91.2 
 
 		 771 aa  1453    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  76.22 
 
 		 766 aa  1173    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 773 aa  1582    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  52.16 
 
 		 789 aa  798    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  54.03 
 
 		 775 aa  805    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  75.81 
 
 		 771 aa  1151    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  55.03 
 
 		 795 aa  802    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  54.27 
 
 		 772 aa  792    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  53.15 
 
 		 789 aa  805    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  39.52 
 
 		 711 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  34.19 
 
 		 655 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.77 
 
 		 698 aa  321  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  31.51 
 
 		 672 aa  305  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  31.37 
 
 		 686 aa  245  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  29.71 
 
 		 676 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  32.05 
 
 		 668 aa  227  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  33.01 
 
 		 677 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  33.54 
 
 		 680 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  30.54 
 
 		 680 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  30.27 
 
 		 753 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 		 731 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 		 573 aa  200  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.18 
 
 		 640 aa  177  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.29 
 
 		 757 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  27.34 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.43 
 
 		 742 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.84 
 
 		 757 aa  105  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  28.48 
 
 		 749 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.48 
 
 		 704 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.61 
 
 		 773 aa  103  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  27.19 
 
 		 746 aa  101  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  28.04 
 
 		 739 aa  100  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.03 
 
 		 738 aa  100  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.48 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  41.73 
 
 		 662 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.39 
 
 		 719 aa  100  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.43 
 
 		 756 aa  99.8  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  29.13 
 
 		 1085 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.14 
 
 		 721 aa  99  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  41.48 
 
 		 725 aa  98.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.45 
 
 		 740 aa  97.8  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  27.36 
 
 		 722 aa  97.8  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.08 
 
 		 709 aa  97.8  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.19 
 
 		 740 aa  97.4  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26 
 
 		 739 aa  97.4  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27 
 
 		 701 aa  97.8  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.32 
 
 		 754 aa  97.4  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  36.05 
 
 		 787 aa  97.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  37.86 
 
 		 744 aa  97.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.73 
 
 		 805 aa  97.1  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.2 
 
 		 577 aa  96.7  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.59 
 
 		 763 aa  97.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.29 
 
 		 718 aa  96.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  36.87 
 
 		 652 aa  97.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.7 
 
 		 742 aa  97.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 810 aa  95.9  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.45 
 
 		 743 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.46 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  39.6 
 
 		 478 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  25.68 
 
 		 810 aa  95.1  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.79 
 
 		 804 aa  95.5  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.52 
 
 		 810 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  27.92 
 
 		 550 aa  94.7  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  38.19 
 
 		 617 aa  95.1  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.81 
 
 		 759 aa  94.7  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.02 
 
 		 801 aa  94.7  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.38 
 
 		 732 aa  94.7  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  25.15 
 
 		 866 aa  94.4  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  29.69 
 
 		 1193 aa  94.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.91 
 
 		 754 aa  94  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  26.37 
 
 		 703 aa  94  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.04 
 
 		 715 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  37.69 
 
 		 352 aa  94  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  27.23 
 
 		 699 aa  94  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  25.3 
 
 		 718 aa  93.2  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  40.77 
 
 		 305 aa  93.2  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  35.81 
 
 		 299 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  37.59 
 
 		 570 aa  92.8  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.86 
 
 		 757 aa  92.4  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  26.47 
 
 		 713 aa  92.4  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  37.41 
 
 		 388 aa  91.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  27.48 
 
 		 764 aa  91.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.46 
 
 		 754 aa  92  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  37.24 
 
 		 580 aa  92  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  26.32 
 
 		 763 aa  90.9  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01950  hypothetical protein  27.07 
 
 		 803 aa  90.5  9e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4753  AAA ATPase central domain protein  26.7 
 
 		 646 aa  90.5  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.239114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  35.76 
 
 		 725 aa  90.5  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  41.27 
 
 		 743 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  36.62 
 
 		 646 aa  90.5  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.79 
 
 		 805 aa  90.5  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  35.95 
 
 		 569 aa  90.1  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  41.98 
 
 		 448 aa  90.5  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  38.52 
 
 		 450 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  41.18 
 
 		 639 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  41.18 
 
 		 634 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.77 
 
 		 806 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  25.74 
 
 		 829 aa  89.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.68 
 
 		 769 aa  89  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>