More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3267 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  54.16 
 
 		 771 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  52.85 
 
 		 766 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  55.3 
 
 		 773 aa  808    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  55.03 
 
 		 773 aa  803    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  68.25 
 
 		 789 aa  1063    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  67.78 
 
 		 789 aa  1049    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 795 aa  1602    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  52.61 
 
 		 771 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  69.04 
 
 		 775 aa  1059    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  73.46 
 
 		 772 aa  1113    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  38.29 
 
 		 711 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 698 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  33.02 
 
 		 655 aa  306  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  32.92 
 
 		 672 aa  294  6e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  30.29 
 
 		 686 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  33.9 
 
 		 668 aa  217  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  30.64 
 
 		 676 aa  213  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 680 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  32.44 
 
 		 680 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.31 
 
 		 640 aa  197  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  31.73 
 
 		 731 aa  195  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  31 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  31.96 
 
 		 677 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  26.64 
 
 		 753 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  42.36 
 
 		 1085 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  42.96 
 
 		 749 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  28.48 
 
 		 550 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.64 
 
 		 754 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.58 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.91 
 
 		 754 aa  100  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  38.62 
 
 		 448 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  37.67 
 
 		 570 aa  100  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.47 
 
 		 739 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  42.66 
 
 		 657 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  34.02 
 
 		 725 aa  99.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  42.66 
 
 		 653 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  36 
 
 		 478 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.57 
 
 		 754 aa  99.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  38.85 
 
 		 744 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  41.79 
 
 		 580 aa  99  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  37.59 
 
 		 442 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  40.85 
 
 		 787 aa  98.2  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  40.41 
 
 		 662 aa  98.2  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  36.3 
 
 		 432 aa  97.8  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  36.73 
 
 		 570 aa  97.4  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  42.22 
 
 		 448 aa  97.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 478 aa  97.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  36.73 
 
 		 577 aa  96.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  37.5 
 
 		 578 aa  96.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  38.19 
 
 		 569 aa  96.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  36.05 
 
 		 570 aa  95.9  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  37.65 
 
 		 1193 aa  95.9  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.92 
 
 		 704 aa  95.5  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  36.05 
 
 		 570 aa  95.1  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  32.2 
 
 		 743 aa  95.1  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.17 
 
 		 773 aa  95.1  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  39.01 
 
 		 617 aa  95.1  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.9 
 
 		 740 aa  94.4  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  34.06 
 
 		 680 aa  93.6  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.52 
 
 		 754 aa  93.6  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1548  AAA ATPase, central region  27.52 
 
 		 688 aa  92.8  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000910509  normal  0.627937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  42.75 
 
 		 656 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.7 
 
 		 757 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  38.03 
 
 		 450 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.4 
 
 		 806 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.75 
 
 		 718 aa  92.8  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  39.86 
 
 		 656 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  33.88 
 
 		 697 aa  92  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.43 
 
 		 742 aa  92  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.47 
 
 		 763 aa  92  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  28.51 
 
 		 739 aa  92  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  43.08 
 
 		 652 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.79 
 
 		 719 aa  91.3  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.42 
 
 		 757 aa  91.3  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.14 
 
 		 742 aa  91.3  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  40.74 
 
 		 445 aa  90.9  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.15 
 
 		 727 aa  90.9  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  40.56 
 
 		 665 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5232  AAA ATPase, central region  27.03 
 
 		 688 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000286955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  41.35 
 
 		 441 aa  89.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  43.9 
 
 		 444 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  35.42 
 
 		 299 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 		 619 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  36.23 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.31 
 
 		 740 aa  89.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  26.3 
 
 		 810 aa  89  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.2 
 
 		 756 aa  89  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  37.16 
 
 		 466 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  36.62 
 
 		 450 aa  88.6  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.2 
 
 		 738 aa  89  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  39.86 
 
 		 634 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  25.43 
 
 		 781 aa  89  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.22 
 
 		 757 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  27.46 
 
 		 713 aa  88.6  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.98 
 
 		 759 aa  88.2  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  41.13 
 
 		 305 aa  88.6  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  35.15 
 
 		 788 aa  88.2  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  40.48 
 
 		 687 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  26.39 
 
 		 703 aa  87.8  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  38.3 
 
 		 450 aa  87.8  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>