More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3054 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 725 aa  1402    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  44.05 
 
 		 678 aa  259  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  38.83 
 
 		 1085 aa  210  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  47.04 
 
 		 656 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  44.75 
 
 		 671 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  45.31 
 
 		 665 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  43.89 
 
 		 697 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  33.68 
 
 		 680 aa  201  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  49.55 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  41.64 
 
 		 682 aa  199  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  31.13 
 
 		 743 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  43.4 
 
 		 788 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  47.79 
 
 		 787 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  46.27 
 
 		 653 aa  197  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  47.53 
 
 		 652 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  46.61 
 
 		 646 aa  196  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  42.91 
 
 		 1193 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  43.56 
 
 		 749 aa  194  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  49.09 
 
 		 689 aa  193  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  38.42 
 
 		 634 aa  193  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  35 
 
 		 744 aa  192  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  45.58 
 
 		 478 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  43.25 
 
 		 687 aa  190  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  38.28 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  37.46 
 
 		 639 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  47.51 
 
 		 698 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 450 aa  187  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  37.58 
 
 		 450 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  47.94 
 
 		 478 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  41.63 
 
 		 466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  46.93 
 
 		 441 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  36.62 
 
 		 459 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  35.74 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  42.48 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  44.21 
 
 		 448 aa  171  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  41.23 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  49.54 
 
 		 450 aa  171  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  36.88 
 
 		 432 aa  171  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  48.65 
 
 		 444 aa  170  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  45.13 
 
 		 662 aa  170  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  42.73 
 
 		 619 aa  169  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  39.38 
 
 		 697 aa  167  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  45.08 
 
 		 445 aa  161  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  45.29 
 
 		 725 aa  160  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  34.6 
 
 		 622 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  46.83 
 
 		 134 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  40 
 
 		 617 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  41.18 
 
 		 352 aa  107  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 		 698 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  39.71 
 
 		 305 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  34.64 
 
 		 569 aa  103  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  34.59 
 
 		 580 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  35.92 
 
 		 299 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  39.34 
 
 		 228 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  38.57 
 
 		 387 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.9 
 
 		 578 aa  96.3  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  39.26 
 
 		 771 aa  95.5  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  27.73 
 
 		 570 aa  94.7  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  27.73 
 
 		 570 aa  94.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.73 
 
 		 570 aa  94.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  37.14 
 
 		 443 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  37.59 
 
 		 771 aa  92.8  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  29.49 
 
 		 332 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32 
 
 		 570 aa  91.7  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  35.67 
 
 		 766 aa  90.9  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.84 
 
 		 577 aa  90.9  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  35.76 
 
 		 773 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  35.76 
 
 		 773 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36.23 
 
 		 795 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  37.09 
 
 		 348 aa  89.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  36.22 
 
 		 677 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  36.99 
 
 		 775 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  34.75 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.92 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  31 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  34.07 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  35.21 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.98 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  35.56 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 		 468 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 328 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  36.43 
 
 		 731 aa  81.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33.16 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.68 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  28.43 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  31.4 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  33.12 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  34.09 
 
 		 327 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  36.11 
 
 		 355 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  31.52 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 711 aa  79.7  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  28.71 
 
 		 328 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  35.71 
 
 		 336 aa  79.7  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  34.07 
 
 		 789 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  34.75 
 
 		 772 aa  79.3  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  35.1 
 
 		 335 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.04 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  32.63 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  35.17 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1077  ATPase central domain-containing protein  34.29 
 
 		 567 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>