More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1669 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  96.22 
 
 
450 aa  892    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
450 aa  925    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  51.16 
 
 
442 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  53.06 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  45.49 
 
 
459 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  47.76 
 
 
450 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  46.19 
 
 
432 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  41.86 
 
 
448 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  45.79 
 
 
448 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  40.09 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  39.78 
 
 
466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  37.72 
 
 
478 aa  302  9e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  41.78 
 
 
441 aa  300  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  46.3 
 
 
787 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  46.29 
 
 
656 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  45.53 
 
 
743 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  45.96 
 
 
697 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  41.39 
 
 
639 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  45.02 
 
 
656 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  43.8 
 
 
744 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  44.65 
 
 
657 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  46.04 
 
 
653 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  44.4 
 
 
652 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  45.59 
 
 
665 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  39.56 
 
 
444 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
680 aa  211  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  45.42 
 
 
619 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  45.45 
 
 
662 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  42.91 
 
 
725 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  44.94 
 
 
634 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  42.91 
 
 
445 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.8 
 
 
1085 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  43.5 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  39.36 
 
 
749 aa  196  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  42.05 
 
 
788 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  41.44 
 
 
671 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  39.38 
 
 
689 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  39 
 
 
682 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  44.34 
 
 
725 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  42.22 
 
 
698 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  40.15 
 
 
687 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  42.4 
 
 
646 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  65.08 
 
 
134 aa  179  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  37.44 
 
 
1193 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  43.41 
 
 
697 aa  173  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  37.64 
 
 
678 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  43.81 
 
 
622 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.72 
 
 
577 aa  134  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  35 
 
 
570 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  32.58 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  32.58 
 
 
570 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  32.13 
 
 
570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.35 
 
 
569 aa  127  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  35.65 
 
 
305 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 
387 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.76 
 
 
299 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.03 
 
 
578 aa  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.79 
 
 
580 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  35.64 
 
 
228 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  32.31 
 
 
352 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  35.45 
 
 
443 aa  106  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 
617 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.7 
 
 
308 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 
428 aa  97.1  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.47 
 
 
424 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  32.11 
 
 
438 aa  93.6  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  34.55 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
731 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 
775 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  29.32 
 
 
699 aa  90.1  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  35.92 
 
 
677 aa  89.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  32.98 
 
 
407 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  30.3 
 
 
776 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  37.5 
 
 
789 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36.62 
 
 
795 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.86 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  30.92 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  36 
 
 
698 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  30.77 
 
 
722 aa  87.8  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.58 
 
 
718 aa  86.7  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  34.53 
 
 
686 aa  86.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  28.99 
 
 
773 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  33.92 
 
 
239 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.15 
 
 
393 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.74 
 
 
723 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  31.38 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  28.16 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  40.28 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  33.95 
 
 
369 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  27.16 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.32 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
493 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  32.09 
 
 
732 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  30.38 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  30.65 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_006686  CND06230  conserved hypothetical protein  32.65 
 
 
1076 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  35.58 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  33.74 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>