More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1133 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 445 aa  880    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  62.27 
 
 		 450 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  58.51 
 
 		 444 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  53.08 
 
 		 639 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  48.85 
 
 		 743 aa  243  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  48.66 
 
 		 656 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  49.22 
 
 		 787 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  48.75 
 
 		 619 aa  236  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  46.15 
 
 		 665 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  50.19 
 
 		 657 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  47.1 
 
 		 653 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  51.95 
 
 		 680 aa  228  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  49.81 
 
 		 652 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  45.8 
 
 		 697 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  42.64 
 
 		 744 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  44.37 
 
 		 656 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  51.82 
 
 		 689 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  46.88 
 
 		 1085 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  47.48 
 
 		 634 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  44.36 
 
 		 450 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  49.43 
 
 		 788 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  43.64 
 
 		 450 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  46.56 
 
 		 698 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  45.23 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  44.72 
 
 		 662 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  35.44 
 
 		 434 aa  199  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  43.82 
 
 		 448 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  47.49 
 
 		 749 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  49.41 
 
 		 682 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  39.85 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  50.56 
 
 		 687 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  36.04 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  40.36 
 
 		 478 aa  195  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  45.28 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  47.39 
 
 		 671 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 		 725 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.55 
 
 		 450 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  41.81 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  42.06 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.57 
 
 		 622 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  45.49 
 
 		 678 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  47.69 
 
 		 697 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  38.04 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  41.41 
 
 		 1193 aa  170  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  48.65 
 
 		 725 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  51.61 
 
 		 134 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  38.53 
 
 		 305 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.27 
 
 		 578 aa  124  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  31.08 
 
 		 570 aa  123  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.8 
 
 		 570 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 577 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  28.04 
 
 		 570 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.02 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.46 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  35.33 
 
 		 580 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  31.64 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  38.54 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  38.12 
 
 		 617 aa  107  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  43.17 
 
 		 308 aa  93.2  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.83 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  40.74 
 
 		 795 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  31.22 
 
 		 822 aa  89  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  33.53 
 
 		 228 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  35.78 
 
 		 451 aa  89  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  42.28 
 
 		 698 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  31.6 
 
 		 1301 aa  88.2  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  40.71 
 
 		 772 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  33.18 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.44 
 
 		 730 aa  87  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  39.26 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  36.46 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  32.57 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  34.16 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  36.62 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  35.21 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  36.14 
 
 		 771 aa  84  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  30.18 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  40.65 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  34.29 
 
 		 680 aa  84  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  40.44 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  34.07 
 
 		 639 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  36.26 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4641  ATPase central domain-containing protein  38.96 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  34.31 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  41.13 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  41.13 
 
 		 773 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  34.03 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  29.88 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  38.73 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  34.62 
 
 		 601 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  31.82 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  31.53 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.61 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  39.84 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  35.16 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  37.41 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>