More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0025 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
443 aa  878    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  43.75 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  37.92 
 
 
352 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  39.62 
 
 
299 aa  193  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  39.64 
 
 
305 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  51.11 
 
 
228 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  37.19 
 
 
744 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  37.7 
 
 
1085 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  34.34 
 
 
743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  32.83 
 
 
725 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  35.94 
 
 
448 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  33.94 
 
 
787 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  36.08 
 
 
697 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 
1193 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  34.07 
 
 
652 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  29.82 
 
 
619 aa  124  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.16 
 
 
577 aa  123  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  35.48 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  35.23 
 
 
622 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  36.67 
 
 
657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  34.74 
 
 
662 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  33.99 
 
 
653 aa  120  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  36.02 
 
 
450 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  33.5 
 
 
656 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 
656 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  36.52 
 
 
665 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  32.08 
 
 
639 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  35.08 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  35.48 
 
 
450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  32.22 
 
 
578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  32.09 
 
 
749 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  34.41 
 
 
432 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  31.8 
 
 
788 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  32.2 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  33.86 
 
 
450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  31.58 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  34.38 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  36.07 
 
 
697 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  31.96 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  32.29 
 
 
444 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  31.19 
 
 
671 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  31.98 
 
 
634 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  32.9 
 
 
434 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  32.07 
 
 
448 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  32.34 
 
 
698 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  29.15 
 
 
680 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 
466 aa  106  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  38.1 
 
 
445 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32.37 
 
 
569 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  29.15 
 
 
687 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  29.36 
 
 
689 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  34.73 
 
 
570 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  34.73 
 
 
570 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  34.73 
 
 
570 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.56 
 
 
570 aa  99.8  8e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  31.61 
 
 
459 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 
646 aa  97.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  37.14 
 
 
725 aa  94  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  29.95 
 
 
682 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9005  predicted protein  28.17 
 
 
337 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.99 
 
 
784 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  29.83 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32 
 
 
723 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 
419 aa  87  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31 
 
 
781 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  39.82 
 
 
698 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.15 
 
 
800 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  34 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  35.38 
 
 
771 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.33 
 
 
577 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.5 
 
 
781 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  27.41 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  27.52 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  36.43 
 
 
773 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  28.46 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  35.66 
 
 
773 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  32.64 
 
 
443 aa  84  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30513  predicted protein  28.93 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.436051  normal  0.665929 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.14 
 
 
759 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  30.57 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  40.32 
 
 
775 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  26.15 
 
 
468 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  32 
 
 
447 aa  84  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.2 
 
 
806 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  31.44 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  36.15 
 
 
771 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  33.87 
 
 
789 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  34.39 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26031  predicted protein  30.81 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392811  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  30.43 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  32.89 
 
 
703 aa  83.2  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.66 
 
 
718 aa  83.2  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.24 
 
 
743 aa  82.4  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  31.41 
 
 
677 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60303  predicted protein  27.13 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.77 
 
 
754 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  34.3 
 
 
789 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  27.61 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>