More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2455 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  100 
 
 		 441 aa  870    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  45.12 
 
 		 448 aa  362  8e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  43.95 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  43.22 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  41.89 
 
 		 466 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  39.24 
 
 		 478 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  46.05 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  42.44 
 
 		 450 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  41.78 
 
 		 450 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  37.28 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  38.9 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  38.6 
 
 		 478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  38.29 
 
 		 442 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  44.75 
 
 		 787 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  44.24 
 
 		 743 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  47.49 
 
 		 652 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  41.64 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  43.97 
 
 		 744 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  46.72 
 
 		 639 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  44.44 
 
 		 657 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  46.37 
 
 		 619 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  41.98 
 
 		 697 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  46.15 
 
 		 653 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  44.15 
 
 		 656 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  42.26 
 
 		 665 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  44.88 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  47.73 
 
 		 662 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 		 656 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  43.89 
 
 		 749 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  44.79 
 
 		 788 aa  189  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  42.8 
 
 		 689 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  42.91 
 
 		 1085 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  43.1 
 
 		 725 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  43.77 
 
 		 634 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  43.9 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  42.31 
 
 		 680 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  42.25 
 
 		 671 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  41.76 
 
 		 682 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  46.93 
 
 		 725 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  39.13 
 
 		 1193 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  42.29 
 
 		 698 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.68 
 
 		 622 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  44.04 
 
 		 646 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  40.46 
 
 		 687 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  58.73 
 
 		 134 aa  163  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  41.05 
 
 		 697 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  40.16 
 
 		 678 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  30.04 
 
 		 570 aa  137  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  30.04 
 
 		 570 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  30.04 
 
 		 570 aa  136  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.49 
 
 		 570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  38.29 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.8 
 
 		 580 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  29.72 
 
 		 569 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  38.18 
 
 		 352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  38.28 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  36.82 
 
 		 617 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.71 
 
 		 578 aa  113  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  36.6 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  35.59 
 
 		 228 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  28.24 
 
 		 299 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  30.33 
 
 		 369 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  43.09 
 
 		 772 aa  94  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.84 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  33.86 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  39.37 
 
 		 686 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 771 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1088  ATPase central domain-containing protein  34.48 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.48 
 
 		 760 aa  90.1  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  40.44 
 
 		 795 aa  89.7  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.51 
 
 		 773 aa  89.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 		 775 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  34.48 
 
 		 698 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 766 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  27.82 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  34.64 
 
 		 677 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  39.84 
 
 		 789 aa  87  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.62 
 
 		 810 aa  86.3  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  40.31 
 
 		 789 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  29.96 
 
 		 771 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  38.33 
 
 		 676 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  30.34 
 
 		 930 aa  85.9  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  32.79 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  32.97 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  31.44 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.33 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 		 773 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 		 773 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.47 
 
 		 801 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.93 
 
 		 723 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  30.8 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  27.86 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  34.78 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.57 
 
 		 737 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.54 
 
 		 459 aa  83.2  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  34.78 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  30.67 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.91 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  31 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>