More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1882 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
617 aa  1275    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.79 
 
 
580 aa  194  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  39.83 
 
 
570 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.45 
 
 
570 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  39.83 
 
 
570 aa  194  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  43.7 
 
 
577 aa  188  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  39.09 
 
 
570 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  40.86 
 
 
578 aa  184  6e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  40.78 
 
 
569 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 
1085 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  36.41 
 
 
1193 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  34.38 
 
 
478 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  33.03 
 
 
662 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  34.26 
 
 
743 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  33.98 
 
 
653 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  29.92 
 
 
678 aa  124  7e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  33.63 
 
 
656 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  34.08 
 
 
725 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  34.08 
 
 
665 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  36.32 
 
 
466 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  34.95 
 
 
697 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  33.73 
 
 
619 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  33.6 
 
 
432 aa  118  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  36.12 
 
 
448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  32.23 
 
 
657 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  38.51 
 
 
656 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  36.82 
 
 
441 aa  115  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  32.91 
 
 
639 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  34.86 
 
 
652 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 
646 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  35.27 
 
 
478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  32 
 
 
744 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  32.44 
 
 
787 aa  111  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 
450 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  37.93 
 
 
634 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  32.74 
 
 
749 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.14 
 
 
727 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
732 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  38.99 
 
 
725 aa  108  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  33.78 
 
 
450 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  37 
 
 
352 aa  107  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.88 
 
 
718 aa  107  9e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  32.86 
 
 
680 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  32.88 
 
 
697 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  32.24 
 
 
434 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  31.35 
 
 
698 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.76 
 
 
719 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 
671 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.57 
 
 
806 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  34.13 
 
 
448 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  39.2 
 
 
444 aa  104  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  32.43 
 
 
450 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.7 
 
 
743 aa  103  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.91 
 
 
709 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  43.54 
 
 
772 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  29.61 
 
 
442 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.88 
 
 
769 aa  101  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  33.92 
 
 
682 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31 
 
 
801 aa  101  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  36.61 
 
 
699 aa  101  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  37.79 
 
 
445 aa  100  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.79 
 
 
742 aa  100  7e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.56 
 
 
723 aa  100  9e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31 
 
 
768 aa  100  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  37.3 
 
 
713 aa  99.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 
369 aa  99.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  38.16 
 
 
771 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.22 
 
 
760 aa  99.8  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  33.61 
 
 
814 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.74 
 
 
737 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.43 
 
 
736 aa  99.4  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
739 aa  99.4  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  32.32 
 
 
704 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.52 
 
 
763 aa  99.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.17 
 
 
742 aa  98.6  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  26.38 
 
 
299 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.93 
 
 
731 aa  98.6  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.49 
 
 
743 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  32.74 
 
 
788 aa  97.8  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.65 
 
 
781 aa  97.8  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.42 
 
 
753 aa  97.8  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  33.78 
 
 
689 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.09 
 
 
759 aa  97.1  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  32.95 
 
 
367 aa  97.1  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  29.96 
 
 
764 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  32.37 
 
 
577 aa  97.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.68 
 
 
737 aa  96.3  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  32.35 
 
 
776 aa  96.7  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  34.64 
 
 
746 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  29.18 
 
 
775 aa  97.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.14 
 
 
739 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.75 
 
 
757 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.1 
 
 
808 aa  96.7  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.84 
 
 
698 aa  96.3  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  37.13 
 
 
622 aa  96.3  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.48 
 
 
738 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.1 
 
 
731 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0575  FtsH peptidase  30.4 
 
 
613 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0102882  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.65 
 
 
305 aa  96.3  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  27.08 
 
 
641 aa  95.9  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>