More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2830 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  48.27 
 
 		 665 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  50.15 
 
 		 656 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  83.87 
 
 		 653 aa  1074    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  52.88 
 
 		 656 aa  707    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 657 aa  1305    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  56.69 
 
 		 639 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  47.64 
 
 		 634 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  40.06 
 
 		 697 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  44.41 
 
 		 697 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  44.72 
 
 		 662 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  38.22 
 
 		 743 aa  352  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  35.24 
 
 		 744 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  37.85 
 
 		 787 aa  335  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  39.28 
 
 		 689 aa  293  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  46.11 
 
 		 725 aa  283  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  37.22 
 
 		 698 aa  273  5.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  35.94 
 
 		 680 aa  270  8.999999999999999e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  34.87 
 
 		 1085 aa  270  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  56.79 
 
 		 619 aa  266  5.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  37.66 
 
 		 671 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  36.63 
 
 		 687 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  42.2 
 
 		 749 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  49.31 
 
 		 682 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  52.42 
 
 		 788 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  48.03 
 
 		 652 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  34.42 
 
 		 622 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  34.61 
 
 		 646 aa  222  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  42.37 
 
 		 1193 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  55.61 
 
 		 450 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  45.39 
 
 		 450 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  54.22 
 
 		 444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  44.65 
 
 		 450 aa  217  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  44.87 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  40.67 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  48.21 
 
 		 432 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  49.43 
 
 		 445 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  44.44 
 
 		 441 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  48.03 
 
 		 448 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.8 
 
 		 450 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  45.88 
 
 		 448 aa  191  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  46.19 
 
 		 478 aa  187  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  43.28 
 
 		 478 aa  184  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  37.26 
 
 		 678 aa  181  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  42.39 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0994  hypothetical protein  33.43 
 
 		 354 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  35.42 
 
 		 569 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  54.84 
 
 		 134 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  30.69 
 
 		 570 aa  142  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  35.27 
 
 		 580 aa  139  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.38 
 
 		 299 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.15 
 
 		 578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  36.07 
 
 		 305 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.79 
 
 		 577 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  28.52 
 
 		 570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  28.52 
 
 		 570 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  28.52 
 
 		 570 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.45 
 
 		 352 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  33.57 
 
 		 387 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.23 
 
 		 617 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  39.16 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  32 
 
 		 228 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  43.36 
 
 		 772 aa  103  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  33.84 
 
 		 697 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  35.52 
 
 		 326 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  42.66 
 
 		 795 aa  99.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  30.83 
 
 		 822 aa  99  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  42.18 
 
 		 789 aa  97.8  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  42.18 
 
 		 789 aa  97.4  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  41.22 
 
 		 775 aa  96.3  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  36.99 
 
 		 771 aa  95.9  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  34.5 
 
 		 328 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  38.86 
 
 		 308 aa  92.8  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 		 391 aa  92.4  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  42.31 
 
 		 698 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  40 
 
 		 766 aa  90.9  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  33.17 
 
 		 332 aa  90.9  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  35.12 
 
 		 326 aa  90.5  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  37.86 
 
 		 686 aa  89  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  33.14 
 
 		 328 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.97 
 
 		 325 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 773 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 		 773 aa  88.2  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  31.44 
 
 		 329 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  31.44 
 
 		 329 aa  88.2  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  28.62 
 
 		 369 aa  86.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  39.26 
 
 		 771 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  33.53 
 
 		 328 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  28.8 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  33.18 
 
 		 753 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  27.35 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  31.4 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  36.62 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  30.4 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.82 
 
 		 723 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  40.15 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  38.97 
 
 		 655 aa  84.7  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  33.16 
 
 		 732 aa  84.7  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  27.42 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>