More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1765 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 655 aa  1336    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.7 
 
 		 698 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  34.58 
 
 		 672 aa  341  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  35.84 
 
 		 711 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  34.6 
 
 		 775 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  34.19 
 
 		 773 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  34.19 
 
 		 773 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  34.54 
 
 		 772 aa  317  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  33.74 
 
 		 789 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  33.44 
 
 		 771 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  33.43 
 
 		 789 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  33.02 
 
 		 795 aa  306  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  32.9 
 
 		 771 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  31.52 
 
 		 766 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  31.72 
 
 		 668 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  29.57 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  31.67 
 
 		 680 aa  231  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  34.26 
 
 		 677 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  28.69 
 
 		 640 aa  228  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  30.6 
 
 		 686 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  31.87 
 
 		 573 aa  217  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  30.69 
 
 		 676 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  31.55 
 
 		 731 aa  194  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  26.95 
 
 		 753 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  39.43 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  43.23 
 
 		 580 aa  100  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  38.12 
 
 		 578 aa  98.2  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.27 
 
 		 704 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  39.61 
 
 		 577 aa  94  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.7 
 
 		 754 aa  94  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  29.89 
 
 		 363 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  41.3 
 
 		 308 aa  91.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  38.52 
 
 		 570 aa  90.9  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  38.52 
 
 		 570 aa  90.5  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  38.52 
 
 		 570 aa  90.5  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.33 
 
 		 757 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  22.25 
 
 		 763 aa  90.5  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.99 
 
 		 757 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  36.69 
 
 		 570 aa  89  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.31 
 
 		 755 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  37.14 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  36.75 
 
 		 662 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.51 
 
 		 754 aa  88.2  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.63 
 
 		 738 aa  88.6  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.36 
 
 		 756 aa  87.8  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  27.56 
 
 		 639 aa  87.4  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  31.02 
 
 		 444 aa  87  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  37.76 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  37.14 
 
 		 725 aa  87  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  26.27 
 
 		 718 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  29.33 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  26.48 
 
 		 699 aa  85.9  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  36.43 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  36.81 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  39.72 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  28.88 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  38.97 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  38.97 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  34.69 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  23.78 
 
 		 703 aa  84  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  37.78 
 
 		 743 aa  84  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  36.99 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  33.1 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 		 656 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  34.04 
 
 		 432 aa  83.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  24.74 
 
 		 550 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 322 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  39.52 
 
 		 335 aa  82.4  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  25.37 
 
 		 763 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.44 
 
 		 772 aa  82.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  35.66 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  37.67 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  35.14 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  35.14 
 
 		 323 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  37.67 
 
 		 332 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  42.4 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  35.4 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  38.3 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  38.69 
 
 		 749 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.09 
 
 		 760 aa  81.3  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  23.54 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.18 
 
 		 738 aa  81.3  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  33.79 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  38.58 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  38.58 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  38.57 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  30.99 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  34.78 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  22.35 
 
 		 744 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.85 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  33.68 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  40.16 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.49 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  36.43 
 
 		 371 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  31.03 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.34 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.57 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.99 
 
 		 773 aa  79.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  34.53 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>