More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0877 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  100 
 
 		 640 aa  1273    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  28.29 
 
 		 698 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  33.94 
 
 		 672 aa  253  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  28.69 
 
 		 655 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  28.35 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  26.47 
 
 		 789 aa  198  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  27.31 
 
 		 795 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  24.2 
 
 		 711 aa  194  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  26.29 
 
 		 789 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  27.77 
 
 		 771 aa  180  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  27.9 
 
 		 771 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  27.18 
 
 		 773 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  27.18 
 
 		 773 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  26.48 
 
 		 772 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  27.58 
 
 		 766 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  27.52 
 
 		 676 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  28.66 
 
 		 686 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  29.72 
 
 		 668 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  24.51 
 
 		 573 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  23.63 
 
 		 731 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  27.63 
 
 		 753 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  25.6 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  25.87 
 
 		 680 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  25.22 
 
 		 677 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  31.91 
 
 		 570 aa  94  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.33 
 
 		 578 aa  92.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  32.19 
 
 		 570 aa  91.7  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  32.19 
 
 		 570 aa  91.7  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  32.62 
 
 		 570 aa  90.5  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  40.88 
 
 		 580 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  37.23 
 
 		 569 aa  87.8  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.48 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  29.95 
 
 		 764 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  34.67 
 
 		 653 aa  80.5  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.57 
 
 		 732 aa  80.1  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  35.88 
 
 		 355 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32 
 
 		 769 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  29.95 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  39.2 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  37.19 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  30.11 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  34 
 
 		 656 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  25.33 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  33.81 
 
 		 744 aa  77.4  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.86 
 
 		 768 aa  77  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  33.61 
 
 		 671 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  25.33 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28 
 
 		 759 aa  76.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  32.84 
 
 		 698 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  28.96 
 
 		 713 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  25.11 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  33.85 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  23.28 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.88 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  30.83 
 
 		 725 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  23.28 
 
 		 323 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.55 
 
 		 727 aa  76.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  33.58 
 
 		 743 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  33.08 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  32.12 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  30.51 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  35.11 
 
 		 749 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.89 
 
 		 719 aa  75.1  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  32.61 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 1085 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.57 
 
 		 801 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  29.71 
 
 		 722 aa  74.7  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.11 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  36.51 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  34.43 
 
 		 682 aa  73.9  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  26.43 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.82 
 
 		 723 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.43 
 
 		 760 aa  73.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  30.49 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32.47 
 
 		 369 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.58 
 
 		 781 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  32.82 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  30.43 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  27.35 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.48 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.09 
 
 		 401 aa  73.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1253  ATPase of the AAA+ class  31.06 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.228629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.21 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.66 
 
 		 800 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.29 
 
 		 756 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  33.73 
 
 		 696 aa  73.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  27.51 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  32.79 
 
 		 680 aa  72  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  32.95 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.63 
 
 		 753 aa  72  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.29 
 
 		 701 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.17 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  28 
 
 		 829 aa  71.6  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  30.94 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  34.59 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  35.16 
 
 		 665 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.43 
 
 		 738 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  31.72 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>