More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1049 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  100 
 
 		 432 aa  896    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  52.23 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  48.85 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  48.84 
 
 		 450 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  46.05 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  47.21 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  45.8 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  47.37 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  46.46 
 
 		 450 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  46.19 
 
 		 450 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  43.02 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  45.16 
 
 		 441 aa  342  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  41.79 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  38.77 
 
 		 787 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  43.48 
 
 		 652 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  42.75 
 
 		 680 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  45.14 
 
 		 743 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  45.14 
 
 		 744 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  45.56 
 
 		 656 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  45.1 
 
 		 697 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  49.11 
 
 		 653 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  43.63 
 
 		 656 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  48.21 
 
 		 657 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  48.21 
 
 		 639 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  47.77 
 
 		 788 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  40.39 
 
 		 749 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.47 
 
 		 1085 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  44.07 
 
 		 671 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  45.37 
 
 		 619 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  43.09 
 
 		 450 aa  199  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  42.51 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  40.86 
 
 		 689 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  42.08 
 
 		 665 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  42.86 
 
 		 698 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  39.21 
 
 		 725 aa  194  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  44.64 
 
 		 634 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  38.85 
 
 		 687 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  44.98 
 
 		 662 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  35.13 
 
 		 646 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  39.69 
 
 		 682 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  37.64 
 
 		 445 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  39.01 
 
 		 1193 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.43 
 
 		 622 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  40.27 
 
 		 725 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  40.43 
 
 		 697 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  60.48 
 
 		 134 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  37.74 
 
 		 678 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  27.5 
 
 		 569 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  34 
 
 		 570 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  33.33 
 
 		 570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  33.33 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.19 
 
 		 570 aa  137  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  29.38 
 
 		 578 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  35.1 
 
 		 305 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  25.72 
 
 		 580 aa  130  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  36.16 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  31.54 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  26.74 
 
 		 577 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  33.6 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  37.28 
 
 		 228 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  30.08 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  36.79 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  37.5 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  35.45 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  42.06 
 
 		 772 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  36.14 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  33.2 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  31.36 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  32.43 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  27.87 
 
 		 348 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.48 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  34.65 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  36.3 
 
 		 795 aa  97.8  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  42.4 
 
 		 686 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.14 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.62 
 
 		 701 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  27.5 
 
 		 806 aa  97.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  30.57 
 
 		 703 aa  97.1  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  29.24 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.26 
 
 		 718 aa  96.3  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  31.4 
 
 		 814 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  31.76 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.5 
 
 		 308 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  32.48 
 
 		 732 aa  96.3  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  32.11 
 
 		 804 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  31.65 
 
 		 699 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  32.34 
 
 		 711 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  29.93 
 
 		 776 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  33.5 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  35 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.05 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  30.51 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  35.26 
 
 		 703 aa  93.6  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  34.97 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.08 
 
 		 737 aa  93.6  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  26.85 
 
 		 328 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.92 
 
 		 753 aa  93.2  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.51 
 
 		 391 aa  93.2  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  31.89 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3711  Adenosinetriphosphatase  33.02 
 
 		 733 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>