More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1893 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  58.09 
 
 		 682 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  56.81 
 
 		 680 aa  665    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  60.33 
 
 		 671 aa  700    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 698 aa  1352    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  52.53 
 
 		 689 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  45.02 
 
 		 788 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  48.15 
 
 		 687 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  39.17 
 
 		 743 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  37.48 
 
 		 787 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  32.2 
 
 		 744 aa  333  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  40.25 
 
 		 646 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  38.2 
 
 		 639 aa  303  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  37.38 
 
 		 657 aa  301  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  37.42 
 
 		 653 aa  296  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  31.39 
 
 		 697 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  37.4 
 
 		 634 aa  291  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  32.41 
 
 		 656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  32.47 
 
 		 656 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  43.44 
 
 		 725 aa  280  5e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  46.13 
 
 		 665 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  47.04 
 
 		 652 aa  260  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.12 
 
 		 1085 aa  243  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  34.65 
 
 		 697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  43.75 
 
 		 662 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  41.07 
 
 		 749 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  47.91 
 
 		 450 aa  218  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  45.42 
 
 		 444 aa  211  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  39.86 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  42.51 
 
 		 442 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  47.06 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  46.95 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  37.39 
 
 		 1193 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  40.75 
 
 		 450 aa  201  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 		 450 aa  200  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  38.08 
 
 		 434 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  47.75 
 
 		 725 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  44.17 
 
 		 622 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  42 
 
 		 478 aa  191  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  42.59 
 
 		 441 aa  188  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  37.41 
 
 		 678 aa  187  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  35.9 
 
 		 450 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  35.55 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  37.66 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  37.68 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  44.39 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  36 
 
 		 299 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  50.81 
 
 		 134 aa  137  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.42 
 
 		 578 aa  130  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.9 
 
 		 352 aa  128  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  29.1 
 
 		 570 aa  122  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.02 
 
 		 570 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  33.59 
 
 		 305 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  37.14 
 
 		 228 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  28.24 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  28.24 
 
 		 570 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32 
 
 		 569 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  27.15 
 
 		 580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.75 
 
 		 617 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.5 
 
 		 577 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  38.92 
 
 		 387 aa  107  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.8 
 
 		 336 aa  97.4  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  38 
 
 		 443 aa  96.3  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  31.17 
 
 		 771 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  32.51 
 
 		 328 aa  92  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 332 aa  92.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  32.32 
 
 		 335 aa  91.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  43.51 
 
 		 775 aa  90.5  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  30.88 
 
 		 336 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.81 
 
 		 326 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  32.79 
 
 		 930 aa  89.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  33.16 
 
 		 329 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  33.16 
 
 		 329 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  43.51 
 
 		 772 aa  87.8  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  35.05 
 
 		 639 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  36.13 
 
 		 328 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.79 
 
 		 718 aa  87  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  30.15 
 
 		 336 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  41.67 
 
 		 789 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  31.71 
 
 		 332 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  33.01 
 
 		 795 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  33.52 
 
 		 328 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.43 
 
 		 781 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 773 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  34.43 
 
 		 322 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.62 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  34.52 
 
 		 325 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 773 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  33.51 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.62 
 
 		 781 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  30.43 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  26.01 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.89 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.66 
 
 		 732 aa  85.1  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.62 
 
 		 800 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  39.37 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1592  AAA ATPase central domain protein  33.04 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.09 
 
 		 737 aa  84.3  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  40.91 
 
 		 789 aa  84  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  31.44 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>