More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5978 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  42.5 
 
 
1193 aa  704    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
1085 aa  2175    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  34.96 
 
 
743 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  33.82 
 
 
787 aa  315  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.89 
 
 
744 aa  298  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  34.25 
 
 
665 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  34.26 
 
 
656 aa  284  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  37.73 
 
 
749 aa  283  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  34.28 
 
 
657 aa  274  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  33.95 
 
 
639 aa  270  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  31.72 
 
 
656 aa  264  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  44.71 
 
 
653 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  31.13 
 
 
634 aa  249  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  37.72 
 
 
697 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  32.52 
 
 
671 aa  237  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 
619 aa  235  4.0000000000000004e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  34.32 
 
 
682 aa  231  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  41.18 
 
 
788 aa  227  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 
698 aa  226  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  32.46 
 
 
689 aa  225  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 
680 aa  224  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  39.76 
 
 
662 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  31.8 
 
 
725 aa  218  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  37.43 
 
 
652 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  43.06 
 
 
646 aa  211  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 
442 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  40.47 
 
 
432 aa  205  5e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  37.8 
 
 
697 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  46.48 
 
 
444 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  41.2 
 
 
450 aa  201  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  38.83 
 
 
725 aa  201  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  42.41 
 
 
448 aa  201  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  40.8 
 
 
450 aa  199  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  45.78 
 
 
450 aa  198  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  44.2 
 
 
687 aa  197  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  46.09 
 
 
445 aa  197  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  40.73 
 
 
466 aa  194  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  45.85 
 
 
448 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
450 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  35.82 
 
 
434 aa  192  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  39.78 
 
 
478 aa  189  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  42.91 
 
 
441 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  36.15 
 
 
478 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  32.52 
 
 
678 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  32.54 
 
 
622 aa  163  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  34.8 
 
 
459 aa  159  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  36.41 
 
 
299 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 
617 aa  134  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  36.32 
 
 
305 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  31.92 
 
 
352 aa  132  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.9 
 
 
569 aa  130  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.1 
 
 
387 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  30.68 
 
 
570 aa  128  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  49.19 
 
 
134 aa  127  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  30.28 
 
 
570 aa  127  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.06 
 
 
570 aa  127  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  40.36 
 
 
443 aa  126  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 
577 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  33.67 
 
 
580 aa  122  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.65 
 
 
578 aa  119  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.35 
 
 
570 aa  118  6e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  42.36 
 
 
795 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  34.55 
 
 
228 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  27.23 
 
 
773 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  39.24 
 
 
771 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  27.23 
 
 
773 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  35.68 
 
 
332 aa  99  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  37.34 
 
 
766 aa  96.3  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  33.51 
 
 
956 aa  95.9  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  35.25 
 
 
698 aa  95.5  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.96 
 
 
718 aa  95.5  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  39.01 
 
 
772 aa  95.1  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  40.48 
 
 
775 aa  95.1  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  26.7 
 
 
771 aa  94.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.65 
 
 
757 aa  94  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  40.46 
 
 
789 aa  93.2  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_41850  predicted protein  28.35 
 
 
685 aa  92.8  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  29.88 
 
 
930 aa  92.8  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  37.31 
 
 
468 aa  93.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.88 
 
 
754 aa  92.4  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  33.04 
 
 
369 aa  92  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  40.46 
 
 
789 aa  92  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  29.55 
 
 
393 aa  91.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  31.13 
 
 
367 aa  91.7  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.66 
 
 
784 aa  90.9  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.36 
 
 
804 aa  90.9  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.66 
 
 
781 aa  90.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.11 
 
 
754 aa  90.1  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  29.18 
 
 
335 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.17 
 
 
800 aa  89.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  28.81 
 
 
731 aa  89.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  35.08 
 
 
401 aa  89.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  29.64 
 
 
425 aa  89.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  29.53 
 
 
405 aa  89.4  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.5 
 
 
739 aa  89.4  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 
781 aa  88.6  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  37.2 
 
 
801 aa  88.6  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  29.43 
 
 
428 aa  88.2  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  30.73 
 
 
400 aa  88.2  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  32.55 
 
 
370 aa  87.8  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>