More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4244 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 686 aa  1423    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  37.13 
 
 		 668 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  37.06 
 
 		 680 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  37.36 
 
 		 680 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  35.14 
 
 		 676 aa  363  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  31.29 
 
 		 672 aa  260  7e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  31.73 
 
 		 771 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  32.03 
 
 		 775 aa  253  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  31.37 
 
 		 773 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  31.37 
 
 		 773 aa  251  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  30.31 
 
 		 789 aa  247  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  30.29 
 
 		 795 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  30.5 
 
 		 771 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  29.47 
 
 		 789 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  30.08 
 
 		 766 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  30.44 
 
 		 772 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  32.66 
 
 		 698 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  32.06 
 
 		 711 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  30.8 
 
 		 655 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  30.59 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  30.13 
 
 		 573 aa  173  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  28.66 
 
 		 640 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  29.56 
 
 		 753 aa  162  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 		 744 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.95 
 
 		 738 aa  100  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  25.84 
 
 		 713 aa  100  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  27.33 
 
 		 787 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  37.86 
 
 		 324 aa  99.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.08 
 
 		 804 aa  97.4  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  42.4 
 
 		 432 aa  97.4  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.55 
 
 		 739 aa  97.1  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  38.03 
 
 		 352 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.78 
 
 		 755 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.95 
 
 		 742 aa  94.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  38.85 
 
 		 450 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  24.37 
 
 		 699 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  36.97 
 
 		 656 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  38.3 
 
 		 448 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.61 
 
 		 757 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  34.78 
 
 		 639 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.61 
 
 		 757 aa  92  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  39.37 
 
 		 441 aa  91.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  24.52 
 
 		 810 aa  91.7  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  33.51 
 
 		 360 aa  90.9  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  36.36 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.98 
 
 		 760 aa  90.5  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  26.07 
 
 		 739 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  31.82 
 
 		 322 aa  90.1  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.5 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.9 
 
 		 801 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  32.73 
 
 		 743 aa  89.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  35.15 
 
 		 656 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.48 
 
 		 852 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  34.67 
 
 		 697 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  37.86 
 
 		 657 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.2 
 
 		 731 aa  89  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  37.86 
 
 		 653 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  24.42 
 
 		 703 aa  88.6  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  23.89 
 
 		 727 aa  88.6  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  25.69 
 
 		 725 aa  88.6  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  40.83 
 
 		 466 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  35.15 
 
 		 422 aa  88.2  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.51 
 
 		 753 aa  87.8  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.41 
 
 		 805 aa  88.2  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  35.37 
 
 		 410 aa  87.8  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.51 
 
 		 759 aa  87.8  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  32.58 
 
 		 414 aa  87.4  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0068  AAA ATPase, central region  35.62 
 
 		 613 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263545  hitchhiker  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37691  predicted protein  45 
 
 		 691 aa  87.4  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556949  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  38.1 
 
 		 478 aa  87.4  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  41.09 
 
 		 601 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  34.9 
 
 		 338 aa  87.4  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.39 
 
 		 740 aa  87  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  32.03 
 
 		 450 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  30.52 
 
 		 1193 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  24.76 
 
 		 754 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.13 
 
 		 577 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  37.31 
 
 		 322 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1253  ATPase of the AAA+ class  34.94 
 
 		 348 aa  87  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.228629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.78 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  33.97 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  35.37 
 
 		 665 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  35.06 
 
 		 634 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  34.01 
 
 		 749 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  32.68 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  30.3 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  23.87 
 
 		 808 aa  85.9  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  34.75 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  34.72 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  31.76 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  38.84 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.06 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.84 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  36.57 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  24.46 
 
 		 810 aa  84.7  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.44 
 
 		 578 aa  84.7  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  34.53 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  36.57 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  32.12 
 
 		 1085 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>