More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2253 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  100 
 
 		 414 aa  833    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  48.67 
 
 		 718 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  47.03 
 
 		 829 aa  194  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.42 
 
 		 773 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  46.58 
 
 		 814 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  46.58 
 
 		 810 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  45.65 
 
 		 769 aa  193  4e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.74 
 
 		 742 aa  192  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  45.06 
 
 		 804 aa  192  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6826  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.92 
 
 		 757 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.17 
 
 		 732 aa  192  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.21 
 
 		 760 aa  191  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.74 
 
 		 742 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.32 
 
 		 736 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40 
 
 		 740 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.39 
 
 		 768 aa  190  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.8 
 
 		 731 aa  190  5e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.37 
 
 		 743 aa  189  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.79 
 
 		 804 aa  189  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.79 
 
 		 739 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  46.85 
 
 		 930 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40 
 
 		 740 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.83 
 
 		 805 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.88 
 
 		 810 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  44.09 
 
 		 757 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.5 
 
 		 759 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  43.64 
 
 		 806 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.12 
 
 		 731 aa  188  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  43.44 
 
 		 703 aa  188  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.14 
 
 		 805 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.8 
 
 		 731 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.22 
 
 		 738 aa  186  5e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  39.12 
 
 		 731 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  36.53 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.81 
 
 		 738 aa  186  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.64 
 
 		 755 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.5 
 
 		 772 aa  185  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.15 
 
 		 510 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  46.72 
 
 		 739 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.18 
 
 		 704 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  44.64 
 
 		 763 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.69 
 
 		 723 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.58 
 
 		 735 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.36 
 
 		 737 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  45.05 
 
 		 764 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.65 
 
 		 737 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  35.8 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.85 
 
 		 738 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  38.4 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.68 
 
 		 754 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.88 
 
 		 754 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.48 
 
 		 781 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0973  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.25 
 
 		 852 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0684344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.69 
 
 		 730 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 		 673 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  41.56 
 
 		 431 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.36 
 
 		 800 aa  179  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 		 673 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  39.6 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.57 
 
 		 639 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.36 
 
 		 754 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  43.3 
 
 		 754 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.24 
 
 		 784 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  33.23 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.37 
 
 		 620 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  46.92 
 
 		 746 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.36 
 
 		 719 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.86 
 
 		 756 aa  178  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  41.11 
 
 		 727 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  33.84 
 
 		 412 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  38 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  42.04 
 
 		 781 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  42.34 
 
 		 713 aa  176  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3574  vesicle-fusing ATPase  44.95 
 
 		 647 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.18 
 
 		 753 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1124  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 		 810 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  35.71 
 
 		 413 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  45.02 
 
 		 776 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  38.49 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  40.23 
 
 		 701 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  45.58 
 
 		 732 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  42.27 
 
 		 709 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  42.22 
 
 		 722 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  41.02 
 
 		 641 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  43.18 
 
 		 721 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  39.92 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  41.3 
 
 		 699 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  39.25 
 
 		 757 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17718  predicted protein  44.58 
 
 		 1177 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  32.35 
 
 		 434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.39 
 
 		 618 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.87 
 
 		 608 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  40.8 
 
 		 763 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  40.87 
 
 		 499 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  36.16 
 
 		 775 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  33.64 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.22 
 
 		 682 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  37.5 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.48 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  38.96 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>