More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1253 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1253  ATPase of the AAA+ class  100 
 
 
348 aa  696    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.228629  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  48.3 
 
 
351 aa  323  3e-87  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.51 
 
 
321 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  28.75 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33.33 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  28.75 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  27.21 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  28.8 
 
 
369 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  28.91 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  27.57 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  38.46 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  27.82 
 
 
335 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  28.4 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  30.65 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  27.02 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  28.83 
 
 
322 aa  89.4  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  30.74 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  28.83 
 
 
336 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  24.26 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  27.69 
 
 
326 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  35.38 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  36.36 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  35.17 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  30.24 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  31.03 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  26.07 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  26.42 
 
 
325 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  35.15 
 
 
686 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  37.5 
 
 
325 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  36.72 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  38.28 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  36.76 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  32.32 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  24.59 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  25.31 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  32.08 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  25.76 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  26.57 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  32.3 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  33.85 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  24 
 
 
328 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  30.97 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  28.24 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  34.4 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  35.2 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  28.48 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  26.03 
 
 
330 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  32.82 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  35.25 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  32.16 
 
 
468 aa  77  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  27.73 
 
 
405 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  40.77 
 
 
687 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  25.29 
 
 
338 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 
428 aa  75.9  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  32.28 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  32.68 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  33.1 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  34.07 
 
 
493 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  34.07 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  34.81 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  26.95 
 
 
655 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.71 
 
 
580 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  34.69 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  26.42 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  34.85 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.92 
 
 
569 aa  72.8  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  31.06 
 
 
640 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  31.07 
 
 
753 aa  72.8  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.45 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  27.01 
 
 
450 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  28.06 
 
 
478 aa  72  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.45 
 
 
570 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  29.8 
 
 
370 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.26 
 
 
324 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  32.9 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  28 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  30.92 
 
 
789 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  25.38 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  30.94 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  28.83 
 
 
570 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  25.28 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  31.06 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  31.93 
 
 
662 aa  69.7  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  35.48 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 
775 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  34.96 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  36.92 
 
 
682 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  31.21 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  32.75 
 
 
788 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  35.38 
 
 
689 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  37.69 
 
 
698 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  29.03 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  29.25 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  29.03 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>