More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0362 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  910    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  56.18 
 
 
478 aa  528  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  54.63 
 
 
450 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  48.85 
 
 
432 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  48.11 
 
 
466 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  49.65 
 
 
448 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  44.77 
 
 
442 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  47.11 
 
 
434 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  42.08 
 
 
450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  41.86 
 
 
450 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  45.12 
 
 
441 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  40.52 
 
 
459 aa  342  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  40.35 
 
 
478 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  39.33 
 
 
787 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  44.31 
 
 
744 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  46.56 
 
 
743 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  44.79 
 
 
652 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  47.08 
 
 
788 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  45.04 
 
 
656 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  44.02 
 
 
689 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  44.06 
 
 
680 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  42.41 
 
 
1085 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  44.26 
 
 
619 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  43.95 
 
 
749 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  45.17 
 
 
682 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  40.96 
 
 
725 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  38.41 
 
 
444 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  45.88 
 
 
657 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  46.86 
 
 
639 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  43.7 
 
 
656 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  43.89 
 
 
634 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  45.61 
 
 
653 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  40.54 
 
 
697 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  44.8 
 
 
450 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 
1193 aa  187  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  41.31 
 
 
671 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  41.92 
 
 
665 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  44.75 
 
 
646 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  45.65 
 
 
445 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  48.39 
 
 
662 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  41.22 
 
 
687 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 
698 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  41.59 
 
 
725 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  40.16 
 
 
678 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  40.39 
 
 
622 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  38.17 
 
 
697 aa  151  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  57.14 
 
 
134 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.39 
 
 
570 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  37.2 
 
 
387 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  36.02 
 
 
578 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.69 
 
 
570 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.59 
 
 
570 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.59 
 
 
570 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  39.29 
 
 
352 aa  138  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  33.46 
 
 
577 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  30.92 
 
 
569 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  37.63 
 
 
305 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  32.16 
 
 
299 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  29.41 
 
 
580 aa  127  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  35.94 
 
 
443 aa  123  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  36.12 
 
 
617 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  41.57 
 
 
367 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  35.88 
 
 
228 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  37.5 
 
 
746 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.42 
 
 
805 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.46 
 
 
718 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  35.19 
 
 
404 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  34.63 
 
 
703 aa  103  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 
391 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  38.07 
 
 
806 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  36.41 
 
 
739 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.42 
 
 
804 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  36.08 
 
 
829 aa  100  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 
805 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.45 
 
 
754 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.42 
 
 
754 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  32.19 
 
 
732 aa  100  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.33 
 
 
405 aa  100  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  31.23 
 
 
599 aa  99.8  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  34.3 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.17 
 
 
737 aa  99.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.59 
 
 
419 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  38.86 
 
 
701 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.74 
 
 
757 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.29 
 
 
742 aa  99  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.29 
 
 
739 aa  98.2  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.02 
 
 
425 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  37.35 
 
 
369 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.96 
 
 
653 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  34.83 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  42.22 
 
 
795 aa  97.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1223  AAA family ATPase  30.21 
 
 
721 aa  97.4  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.54 
 
 
763 aa  97.1  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  35.84 
 
 
677 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.38 
 
 
810 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.29 
 
 
723 aa  96.7  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  36.08 
 
 
808 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.59 
 
 
577 aa  96.7  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  36.99 
 
 
370 aa  96.3  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  33.18 
 
 
436 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>