More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3811 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 788 aa  1501    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  48.48 
 
 		 680 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  46.36 
 
 		 671 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  43.66 
 
 		 698 aa  499  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  45.36 
 
 		 682 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  44.2 
 
 		 689 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  43.07 
 
 		 687 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  36.4 
 
 		 743 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  33.95 
 
 		 787 aa  346  8.999999999999999e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.51 
 
 		 744 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  30.71 
 
 		 656 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  51.03 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  55.17 
 
 		 619 aa  264  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  49.82 
 
 		 656 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  40.56 
 
 		 653 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  36.96 
 
 		 646 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  38.01 
 
 		 725 aa  256  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  48.6 
 
 		 634 aa  255  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 697 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  50.18 
 
 		 639 aa  250  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  52.42 
 
 		 657 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  36.49 
 
 		 665 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  44.07 
 
 		 1085 aa  230  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  47.1 
 
 		 749 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  50.57 
 
 		 444 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  48.21 
 
 		 432 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  47.69 
 
 		 448 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  46.3 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  43.56 
 
 		 450 aa  210  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  49.24 
 
 		 450 aa  207  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  42.42 
 
 		 450 aa  204  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  48.89 
 
 		 478 aa  202  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  39.63 
 
 		 697 aa  201  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  42.08 
 
 		 442 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  49.63 
 
 		 445 aa  197  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  41.79 
 
 		 1193 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  39 
 
 		 434 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  41.25 
 
 		 466 aa  194  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  44.49 
 
 		 441 aa  194  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  41.46 
 
 		 450 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  43.4 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  42.64 
 
 		 622 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  47.16 
 
 		 448 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  39.71 
 
 		 459 aa  171  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  41.04 
 
 		 678 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  38.94 
 
 		 352 aa  144  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  40.48 
 
 		 305 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  34.98 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  37.45 
 
 		 387 aa  127  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  50 
 
 		 134 aa  126  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  33.46 
 
 		 578 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32 
 
 		 570 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  31.37 
 
 		 580 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  32.83 
 
 		 569 aa  118  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  27.86 
 
 		 570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  27.86 
 
 		 570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.86 
 
 		 570 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.24 
 
 		 577 aa  112  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  36.21 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  31.8 
 
 		 443 aa  111  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.74 
 
 		 617 aa  100  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01640  ATPase, putative  34.05 
 
 		 1159 aa  95.1  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.47 
 
 		 391 aa  94.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  42.28 
 
 		 775 aa  88.6  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  30.6 
 
 		 764 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.51 
 
 		 756 aa  88.2  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  35.15 
 
 		 795 aa  88.2  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  31.97 
 
 		 956 aa  86.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.33 
 
 		 781 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  40.71 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  35.38 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.56 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  36.41 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0450  Microtubule-severing ATPase  35.94 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.330417 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.92 
 
 		 784 aa  85.5  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  40.29 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  41.98 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  36.94 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  42.75 
 
 		 772 aa  84.7  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  32.28 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  31.38 
 
 		 822 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 		 367 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  32.87 
 
 		 686 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  38.64 
 
 		 789 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  39.69 
 
 		 773 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  39.69 
 
 		 773 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.25 
 
 		 754 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.92 
 
 		 781 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  33.15 
 
 		 405 aa  83.2  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  28.34 
 
 		 829 aa  83.2  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.51 
 
 		 800 aa  83.2  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1596  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.97 
 
 		 801 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.949234  normal  0.0587091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  39.68 
 
 		 771 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  39.84 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  39.84 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.36 
 
 		 757 aa  82  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  29.58 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1429  ATPase central domain-containing protein  35.29 
 
 		 464 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  35.33 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  26.5 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>