More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1774 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  100 
 
 
580 aa  1157    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  57.66 
 
 
577 aa  664    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  64.7 
 
 
569 aa  733    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  54.92 
 
 
570 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  54.92 
 
 
570 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  54.75 
 
 
570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  50.77 
 
 
578 aa  580  1e-164  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  54.94 
 
 
570 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  29.79 
 
 
617 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  33.45 
 
 
725 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  35.27 
 
 
657 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  29.52 
 
 
434 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  33.93 
 
 
662 aa  133  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 
653 aa  133  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  28.64 
 
 
656 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  31.92 
 
 
656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 
619 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  25.72 
 
 
432 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  32.03 
 
 
478 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  31.7 
 
 
697 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  31.14 
 
 
689 aa  127  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  29.41 
 
 
448 aa  127  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  28.68 
 
 
639 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  30.04 
 
 
442 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  31.69 
 
 
634 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  32.77 
 
 
665 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  34.92 
 
 
305 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  31.64 
 
 
743 aa  123  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  29.55 
 
 
450 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  32.78 
 
 
744 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  28.76 
 
 
652 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  30.45 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  30.8 
 
 
441 aa  121  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  31.65 
 
 
749 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  33.67 
 
 
1085 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  29.8 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  32.68 
 
 
466 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  32.82 
 
 
444 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  29.79 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  28.79 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 
788 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  30.67 
 
 
697 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  35.47 
 
 
445 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  31.39 
 
 
698 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  33.19 
 
 
671 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  34.84 
 
 
387 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  32.09 
 
 
1193 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  32.44 
 
 
459 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  32.8 
 
 
678 aa  107  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  30.45 
 
 
450 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  29.52 
 
 
680 aa  107  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  30.67 
 
 
687 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
443 aa  105  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  33.03 
 
 
352 aa  104  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  30.53 
 
 
787 aa  104  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  34.88 
 
 
682 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  32.9 
 
 
789 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  34.59 
 
 
725 aa  100  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  43.23 
 
 
655 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  41.26 
 
 
775 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  41.67 
 
 
789 aa  99  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  29.73 
 
 
299 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  41.79 
 
 
795 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  41.04 
 
 
772 aa  98.2  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  28.62 
 
 
391 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  29.17 
 
 
646 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  41.61 
 
 
676 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 
622 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  38.1 
 
 
711 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 
698 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1672  ATPase central domain-containing protein  30 
 
 
369 aa  94  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00463679  normal  0.710335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  38.32 
 
 
668 aa  94  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  31.43 
 
 
228 aa  93.6  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  34.04 
 
 
425 aa  91.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  37.24 
 
 
773 aa  92  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  32.32 
 
 
680 aa  91.3  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  41.55 
 
 
672 aa  91.3  4e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  36.55 
 
 
773 aa  90.9  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  30.04 
 
 
468 aa  90.9  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  29.38 
 
 
367 aa  90.1  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  37.5 
 
 
766 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  31.94 
 
 
369 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  33.13 
 
 
680 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  32.04 
 
 
317 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  40.88 
 
 
640 aa  89.7  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.26 
 
 
332 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  39.85 
 
 
771 aa  88.6  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  30.53 
 
 
355 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  29.95 
 
 
419 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.12 
 
 
428 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  31.56 
 
 
425 aa  87.8  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.77 
 
 
801 aa  87.8  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  29.69 
 
 
402 aa  87.4  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.65 
 
 
732 aa  87.4  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  35.67 
 
 
753 aa  87.4  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  32.2 
 
 
405 aa  87.4  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.23 
 
 
477 aa  87.4  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  34.48 
 
 
771 aa  87  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  26.22 
 
 
493 aa  86.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  32.35 
 
 
321 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>