More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0827 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 697 aa  1372    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  38.34 
 
 		 697 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  43.98 
 
 		 657 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  41.94 
 
 		 639 aa  416  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  43.73 
 
 		 653 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  38.27 
 
 		 656 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  41.12 
 
 		 634 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  38.89 
 
 		 665 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  38.63 
 
 		 656 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  29.96 
 
 		 744 aa  296  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  32.97 
 
 		 743 aa  289  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  34.74 
 
 		 787 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  35.34 
 
 		 662 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  39.54 
 
 		 725 aa  251  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  33.72 
 
 		 671 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  35.65 
 
 		 689 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  33.76 
 
 		 698 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  47.06 
 
 		 652 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  42.53 
 
 		 680 aa  216  9e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 		 1085 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  44.11 
 
 		 749 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  33.39 
 
 		 682 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  42.95 
 
 		 788 aa  207  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  48.72 
 
 		 619 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  32.71 
 
 		 687 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  44.44 
 
 		 646 aa  196  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  43.24 
 
 		 1193 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  44.02 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  42.86 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  32.44 
 
 		 622 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  42.4 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  42.4 
 
 		 450 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  48.11 
 
 		 445 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  44.33 
 
 		 442 aa  173  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  35.75 
 
 		 678 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  39.36 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  39.38 
 
 		 725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  38.55 
 
 		 432 aa  165  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  41.13 
 
 		 441 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  40.39 
 
 		 466 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  36.33 
 
 		 448 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  42.11 
 
 		 448 aa  152  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  37.25 
 
 		 434 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.71 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  40.78 
 
 		 478 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  44.02 
 
 		 459 aa  149  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  33.94 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  46.77 
 
 		 134 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.3 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  31.51 
 
 		 569 aa  117  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.8 
 
 		 580 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  27.17 
 
 		 570 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  26.79 
 
 		 570 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30 
 
 		 578 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  28.22 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  32.83 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  29.46 
 
 		 570 aa  112  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  33.52 
 
 		 228 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  39.63 
 
 		 443 aa  107  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  31.18 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  31.05 
 
 		 352 aa  104  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.68 
 
 		 387 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  33.88 
 
 		 795 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0994  hypothetical protein  29.02 
 
 		 354 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  36.73 
 
 		 772 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  34.63 
 
 		 336 aa  91.3  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  31.56 
 
 		 336 aa  90.5  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  36.73 
 
 		 789 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  36.73 
 
 		 789 aa  90.5  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  30.18 
 
 		 335 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  30.23 
 
 		 822 aa  89  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 775 aa  89  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  34.71 
 
 		 771 aa  88.6  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  34.07 
 
 		 326 aa  87.8  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  31.33 
 
 		 327 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  33.99 
 
 		 336 aa  87  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  33.51 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  25.09 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  31.22 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  35.6 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  33.64 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  33.17 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  31.22 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  38.46 
 
 		 776 aa  84.3  0.000000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  37.08 
 
 		 328 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  32.16 
 
 		 369 aa  83.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  36.3 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  33.33 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  36.3 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  37.4 
 
 		 766 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  35.43 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  29.84 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  31.85 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  30.08 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  29.38 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  35.46 
 
 		 668 aa  80.5  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  31.41 
 
 		 336 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 698 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  30.94 
 
 		 328 aa  80.1  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>