12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0994 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0994  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  713    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  29.32 
 
 
656 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  33.43 
 
 
657 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  32.84 
 
 
653 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
639 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  27.44 
 
 
656 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  26.17 
 
 
665 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  29.85 
 
 
634 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  25.93 
 
 
697 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  30.07 
 
 
697 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 
662 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  29.17 
 
 
743 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>