More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0297 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  100 
 
 
635 aa  1263    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2284  putative cell division protein  39.13 
 
 
634 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0284876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6052  AAA ATPase central domain protein  39.12 
 
 
634 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.248698 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5769  ATPase central domain-containing protein  43.76 
 
 
637 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0812  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.36 
 
 
651 aa  330  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0310743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.41 
 
 
608 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.12 
 
 
673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.12 
 
 
673 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  41.46 
 
 
625 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  41.11 
 
 
620 aa  320  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.02 
 
 
666 aa  320  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4275  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.32 
 
 
667 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  36.16 
 
 
608 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  41.52 
 
 
621 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.47 
 
 
623 aa  319  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  41.78 
 
 
624 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  42.22 
 
 
635 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.79 
 
 
651 aa  317  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.98 
 
 
640 aa  317  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.64 
 
 
643 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  37.48 
 
 
618 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.68 
 
 
652 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  34.8 
 
 
614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.47 
 
 
783 aa  314  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.93 
 
 
644 aa  314  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.22 
 
 
662 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.58 
 
 
614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2804  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.49 
 
 
645 aa  314  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  40.94 
 
 
645 aa  313  4.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.88 
 
 
622 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.55 
 
 
612 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.67 
 
 
602 aa  313  5.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  40.89 
 
 
620 aa  313  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  40.97 
 
 
619 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  40.17 
 
 
623 aa  312  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.06 
 
 
714 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 
644 aa  312  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0456572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.59 
 
 
611 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.31 
 
 
673 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  40.35 
 
 
629 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.4 
 
 
640 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.16 
 
 
647 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  37.94 
 
 
612 aa  311  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  39.6 
 
 
658 aa  310  4e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.4 
 
 
642 aa  310  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.4 
 
 
642 aa  310  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2393  FtsH peptidase  39.91 
 
 
619 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00023499  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1180  cell division protein FtsH  38.39 
 
 
617 aa  310  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334987  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.18 
 
 
642 aa  309  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.9 
 
 
641 aa  309  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.29 
 
 
630 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  40.67 
 
 
620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1207  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.96 
 
 
643 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390556  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.04 
 
 
750 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.05 
 
 
612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  36.11 
 
 
635 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  39.87 
 
 
673 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  39.91 
 
 
625 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  35.59 
 
 
639 aa  308  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.27 
 
 
654 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.4 
 
 
640 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.96 
 
 
646 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.96 
 
 
646 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  40.84 
 
 
624 aa  306  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.56 
 
 
646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.98 
 
 
714 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.6 
 
 
650 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.81 
 
 
696 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  35.98 
 
 
646 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.18 
 
 
640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.56 
 
 
617 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.98 
 
 
621 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
666 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01970  ATP-dependent peptidase, putative  38.99 
 
 
782 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.12 
 
 
621 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.73 
 
 
635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
666 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.38 
 
 
626 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  40.5 
 
 
644 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.5 
 
 
647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  40.5 
 
 
644 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  40.5 
 
 
644 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  40.5 
 
 
647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  40.5 
 
 
647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  40.5 
 
 
647 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  40.5 
 
 
644 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  38.96 
 
 
883 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.67 
 
 
852 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.83 
 
 
616 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  40.14 
 
 
628 aa  303  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  40 
 
 
639 aa  303  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  40 
 
 
639 aa  303  7.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  40.67 
 
 
917 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  39.82 
 
 
649 aa  303  7.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.38 
 
 
621 aa  303  7.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.25 
 
 
759 aa  302  9e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.22 
 
 
651 aa  302  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>