More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6052 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5769  ATPase central domain-containing protein  78.02 
 
 
637 aa  1001    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2284  putative cell division protein  94.16 
 
 
634 aa  1205    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0284876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6052  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
634 aa  1291    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.248698 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0297  putative cell division protein  39.02 
 
 
635 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.168134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  37.9 
 
 
614 aa  324  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  36.41 
 
 
608 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.6 
 
 
621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  40.53 
 
 
700 aa  307  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  39.42 
 
 
654 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.59 
 
 
676 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.18 
 
 
637 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.19 
 
 
616 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 
697 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.82 
 
 
697 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.65 
 
 
612 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  35.33 
 
 
637 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  43.18 
 
 
636 aa  300  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.94 
 
 
602 aa  300  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.74 
 
 
612 aa  300  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.19 
 
 
639 aa  299  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.64 
 
 
662 aa  299  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.78 
 
 
660 aa  298  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02481  cell division protein FtsH2  36.2 
 
 
617 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.03 
 
 
652 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02471  cell division protein FtsH2  36.01 
 
 
617 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.18 
 
 
617 aa  296  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  35.81 
 
 
617 aa  296  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.86 
 
 
605 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.57 
 
 
625 aa  295  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02581  cell division protein FtsH2  31.71 
 
 
619 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.72 
 
 
607 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  43.2 
 
 
605 aa  293  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  38.25 
 
 
682 aa  293  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.78 
 
 
646 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.63 
 
 
645 aa  293  7e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.78 
 
 
646 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  36.96 
 
 
696 aa  293  9e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.75 
 
 
646 aa  293  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.81 
 
 
611 aa  293  9e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  40.87 
 
 
656 aa  292  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000729584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.83 
 
 
640 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.6 
 
 
651 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  38.6 
 
 
627 aa  292  1e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3484  FtsH-2 peptidase  37.68 
 
 
621 aa  292  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.29 
 
 
617 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00193369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.52 
 
 
510 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.76 
 
 
615 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.06 
 
 
632 aa  291  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0297  FtsH peptidase  32.4 
 
 
613 aa  291  3e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.13 
 
 
647 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.57 
 
 
666 aa  291  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  38.08 
 
 
658 aa  290  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.14 
 
 
635 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.09 
 
 
615 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02481  cell division protein FtsH2  34.62 
 
 
602 aa  290  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2062  vesicle-fusing ATPase  40.84 
 
 
617 aa  290  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139839  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.84 
 
 
635 aa  290  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.45 
 
 
631 aa  289  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.46 
 
 
659 aa  289  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.27 
 
 
645 aa  289  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.63 
 
 
626 aa  288  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  37.11 
 
 
626 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  36.85 
 
 
798 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.33 
 
 
657 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.8 
 
 
640 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.35 
 
 
640 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  35.1 
 
 
645 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  38.98 
 
 
665 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.45 
 
 
672 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.87 
 
 
639 aa  287  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  39.25 
 
 
625 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.85 
 
 
641 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  36.85 
 
 
641 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.95 
 
 
635 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.94 
 
 
685 aa  287  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  38.95 
 
 
635 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3575  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.89 
 
 
616 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  37.3 
 
 
652 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  36.75 
 
 
620 aa  286  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.97 
 
 
687 aa  286  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.14 
 
 
643 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.25 
 
 
630 aa  286  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.44 
 
 
662 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.72 
 
 
635 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  39.37 
 
 
633 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  36.17 
 
 
689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.4 
 
 
684 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.24 
 
 
624 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.565531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.35 
 
 
793 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.19 
 
 
643 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.42 
 
 
673 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.88 
 
 
633 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.27 
 
 
651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  35.99 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0751  FtsH peptidase  35.32 
 
 
637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.87 
 
 
636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0873  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.06 
 
 
645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.42 
 
 
673 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.74 
 
 
648 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  34.03 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>